無法使用SQL和ODBC連接將R數據幀保存到filemaker Pro數據庫

我有一個Filemaker Pro 12關係數據庫，用於接受手術治療的肺癌患者。由於一名患者可能在一次或多次手術中切除了一個或多個癌症等，因此患者特徵/人口統計數據在一張表格（患者）中，他們手術的患者在另一張表格（治療）中，患者ID和癌症特徵在由PatientID確定的另一個表格（病理學）中，但是通過手術表的SurgeryID與癌症被去除相關聯。無法使用SQL和ODBC連接將R數據幀保存到filemaker Pro數據庫

我想將所有「內部加入」數據備份爲一個平面文件，每個不同癌症的記錄以及每位患者的每項手術（因此如果患者有多個癌症和/或操作）。

con = odbcConnect("LC", uid = "uid", pwd = "pwd") 
PatSurg <-sqlQuery(con, paste("SELECT * FROM Patient P INNER JOIN Treatment T ON P.PatientID = T.PatientID")) 
PatPath <-sqlQuery(con, paste("SELECT * FROM Patient P INNER JOIN Pathology H ON P.PatientID = H.PatientID")) 
Full <- merge(PatSurg, PatPath, by = intersect(names(PatSurg), names(PatPath))) 
View(Full)

這成功地創建的數據幀（全部）完全一樣的平坦平面文件我想保存到一個空的現有的Filemaker：

我已經使用因此進口3個的Filemaker表病人，治療，病理學Pro數據庫與表胸相同的列名稱。

我當時想我會嘗試簡單的指令：

sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic")

，並返回錯誤：

Error in sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic") : table ‘Thoracic’ already exists

氣餒，我放棄了表名，並重新保存它：

sqlDrop(con, "Thoracic", errors = FALSE) 
sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic")

其中返回了一個新的錯誤：

Error in sqlSave(con, Full, tablename = "Thoracic") : [RODBC] Failed exec in Update HY000 502 [FileMaker][FileMaker] (502): Field failed numeric value validation test

然後我想，也許我應該使用sqlQuery命令和INSERT，但不知道如何在SQL/ODBC表達式時引用我的R數據框。我想：

sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic ", Full) 
sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic VALUES", Full)

兩個返回：

Error in if (errors) return(odbcGetErrMsg(channel)) else return(invisible(stat)) : argument is not interpretable as logical In addition: Warning message: In if (errors) return(odbcGetErrMsg(channel)) else return(invisible(stat)) : the condition has length > 1 and only the first element will be used

sqlAppendTable(con, "Thoracic", Full)

Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function ‘sqlAppendTable’ for signature ‘"RODBC"’

sqlQuery(con, "INSERT INTO Thoracic VALUES Full")

[1] "42000 8310 [FileMaker][FileMaker] FQL0001/(1:29): There is an error in the syntax of the query." [2] "[RODBC] ERROR: Could not SQLExecDirect 'INSERT INTO Thoracic VALUES Full'"

我應該如何在SQL查詢中引用我的R數據框「Full」。我所看到的所有問題都只涉及將數據從OBDC源導入數據框。這是最簡單的一點！

來源

2017-09-06 Gav

我已經發現了明顯的解決方法

我已經安裝WriteXLS和導出的數據幀到XLSX文件，然後簡單地使用第一行作爲列名的輸入：

install.packages("WriteXLS") 
library(WriteXLS) 
WriteXLS(Full, "SQL Backup.xlsx")

然後使用導入Filemaker Pro的功能。無論原始格式如何，包含某些字符的自由文本都存在一些問題，並且所有返回的格式都是yyyy-mm-dd格式。主要問題是，如果自由文本包含分隔符，則可能會出現行內右移幀，因此應該是最後一列。我剛糾正XLSX文件中的那些文件，並根據PatientID，SurgeryID和DiagnosisID重新導入爲更新。

Addit：實際上，我發現導出爲.csv可以糾正這些小問題。

來源

2017-09-07 12:04:03 Gav

無法使用SQL和ODBC連接將R數據幀保存到filemaker Pro數據庫

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