R中的XGBoost故障排除

我有一個包含25000行和761列的數據集，其中包含一個二進制響應列。我的二進制響應的值爲'-1'和'1'。我試圖在其上運行xgboost，並不斷收到這says-R中的XGBoost故障排除

xg_base<-xgboost(data = features,label = output,objective="binary:logistic",eta=1,nthreads=2,nrounds = 10 
      , verbose = T, print.every.n = 5) 


Error in xgb.iter.update(bst$handle, dtrain, i - 1, obj) : 
label must be in [0,1] for logistic regression

錯誤我使用下面的命令 -

levels(output)[levels(output)=="-1"] <- "0"

我還是繼續得到同樣的錯誤改變了我的響應水平，我不確定這個問題到底是什麼。重要的一點是，這是一個罕見的事件檢測問題，陽性病例的比例爲總觀測值的1％。這可能是我得到錯誤的原因嗎？

來源

2016-05-05 Mridul Garg

我認爲'輸出'變量必須在0和1之間，而不是一個因素。使用'xgboost'時可能需要重新編碼響應。 – steveb

後更改-1的爲0的，改變從要素output到數字：

output <- as.numeric(levels(output))[output]

我不認爲的事實，這是一種罕見的事件檢測問題與錯誤。

來源

2016-05-05 06:49:01 David

這樣做可以幫助有人試圖將等級0和1的因子變量轉換爲XGBoost輸入的標籤，您需要知道在轉換爲整數（或數字）後需要減去1：

> f <- as.factor(c(0, 1, 1, 0)) 

# XGBoost will not accept this for label 
> as.integer(f) 
[1] 1 2 2 1 

# Correct label 
> as.integer(f) - 1 
[1] 0 1 1 0

來源

2016-07-28 21:46:18 arun

在運行Xgboost模型之前，我們必須牢記某些步驟。

所有變量應該是數字
用於二元分類，您的輸出變量應的範圍從0到1

使用水平（輸出）水平（輸出）== 「 - 1」 ] < - 「0」 ,,你的輸出變量將是字符。將其更改爲數字，將範圍保持在0到1之間，並且Xgboost模型可能會工作。

來源

2017-09-06 11:29:19

R中的XGBoost故障排除

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