試圖運行來自不同位置的shell腳本，但錯誤說我試圖創建一個目錄

Question

我試圖運行下面的腳本，讓我們從比它的工作目錄以外的其他位置調用它foo.sh：

var1="$1" 
var2="$2" 

for SNR_NR in $var1; do 
    for parts in $var2; do 
     # echo *-$SNR_NR-$parts 
     for file in *-$SNR_NR-$parts; do 
     cat "$file" | sed -n '3p' \ 
        | sed 's/$/,/' >> tmp 
     cat "$file" | sed -n '4p' \ 
        | tr ' ' ',' \ 
        | sed 's/^.\(.*\).$/\1/' >> tmp 
     done 
    done 
    # Concatenate the above onto one line 
    paste -d " " - - < tmp 
    rm tmp 
done 

它很簡單，它從工作目錄運行得非常好，因爲它使用兩個數字整數參數。

現在，如果我嘗試從比工作目錄之外的其他地方運行它，我得到的錯誤是：

/data/RESULTS/foo.sh: 18: /data/RESULTS/foo.sh: cannot create tmp: Is a directory 
cat: *-0-500: No such file or directory 
/data/RESULTS/foo.sh: 22: /data/RESULTS/foo.sh: cannot create tmp: Is a directory 
cat: *-0-500: No such file or directory 
paste: -: Is a directory 
paste: -: Is a directory 
rm: cannot remove ‘tmp’: Is a directory 

我曾嘗試加入我的工作目錄到$PATH，但它仍然無法正常工作。運行ls -la on foo.sh給出-rw-------但是做chmod +x foo.sh仍然不起作用。

最奇怪的部分是，它試圖創建一個名爲tmp的目錄，我不太明白，因爲它只是一個臨時文件來存儲一些中間結果，然後將其打印到shell。

編輯：

將船上的建議，從意見後，以下現在生產這個錯誤，而不是，這是一種進步：

：

var1="$1" 
var2="$2" 

for SNR_NR in $var1; do 
    for parts in $var2; do 
     # echo *-$SNR_NR-$parts 
     for file in *-$SNR_NR-$parts; do 
     cat "$file" | sed -n '3p' \ 
        | sed 's/$/,/' >> brian 
     cat "$file" | sed -n '4p' \ 
        | tr ' ' ',' \ 
        | sed 's/^.\(.*\).$/\1/' >> brian 
     done 
    done 
    # Concatenate the above onto one line 
    paste -d " " - - < brian 
    rm brian 
done 

與sh foo.sh 5 500運行結果

cat: *-0-500: No such file or directory 
cat: *-0-500: No such file or directory 

SOLUTION：

一個簡單的重寫產生

var1="$1" 
var2="$2" 
# Supply results/script directory as argument 
var3 = "$3" 

# cd into script directory before running it 
cd $var3 

for SNR_NR in $var1; do 
    for parts in $var2; do 
     # echo *-$SNR_NR-$parts 
     for file in *-$SNR_NR-$parts; do 
     cat "$file" | sed -n '3p' \ 
        | sed 's/$/,/' >> brian 
     cat "$file" | sed -n '4p' \ 
        | tr ' ' ',' \ 
        | sed 's/^.\(.*\).$/\1/' >> brian 
     done 
    done 
    # Concatenate the above onto one line 
    paste -d " " - - < brian 
    rm brian 
done 

Answer 1

不，它試圖創建一個文件tmp但tmp是已經在該位置的目錄。

這就是爲什麼> tmp，< tmp和rm tmp全部失敗，is a directory錯誤，因爲沒有人可以對目錄進行操作。

如果您想要一個安全的臨時文件，請使用mktemp。

Answer 2

您已擁有一個名爲'tmp'的目錄，因此無法創建具有該名稱的文件。你可以在你的腳本開始這樣做趕上這樣的情況：

if [[ -d tmp ]] 
then 
    echo I can not execute this script, because a directory named tmp exists 
    ls -ld tmp 
    exit 1 
fi 

當然tmp的是不是反正臨時文件最好的名字....