我在使用ggplot2分面圖時過寬的面板標籤時遇到問題。用ggplot調整面板標籤寬度
這裏是我用來生成劇情代碼:
png(paste("/directory/", hgnc_symbol, "_", curr_gene, ".png", sep=""),
width=4, height=3, units="in", pointsize=1, res=300)
print({barplot <-
ggplot(curr_data, aes(x = condition, y = tpm, fill=condition)) +
geom_boxplot(outlier.colour=NA, lwd=0.2, color="grey18") +
stat_boxplot(geom ='errorbar', color="grey18") +
geom_jitter(size=0.8) +
facet_wrap(~target_id) +
guides(fill=FALSE) +
theme_bw() +
labs(title=paste(hgnc_symbol, "_", curr_gene, sep="")) +
labs(x="condition") + labs(y="TPM") +
theme(text = element_text(size=5), strip.background=element_rect(size = 1),
axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1, size=4.5))})
dev.off()
情節找出來是這樣的:
正如你所看到的,面板的背景標籤如此之廣,以至於這些情節本身幾乎不可見。圖上繪製的點也比我預期的要大得多。
奇怪的是,我用這個完全相同的代碼生成此下面的圖形(看起來好)短短數天前:
是什麼導致了這種差異,我怎麼能解決問題?
當您提供一些示例數據時,您可以獲得更好的結果。但是,我認爲問題是ggplot用於繪圖和標籤的不同尺度。你說你使用完全相同的代碼得到了不同的結果。我敢打賭,你將圖表保存在不同的維度下。試着增加你的寬度和高度,看看你的結果是否接近你的第二個更理想的圖。 – oshun