編譯使用mpi的庫（AGMG）

用於並行例如make文件正在尋找這樣的：

# MPIopt = -I/... (where to find mpif.h) 
# MUMPSPopt = -I/... (where to find files to be included by 
#      applications using MUMPS) 
# MUMPSlib = -l... (link reference for MUMPS) 
# SCALAP = -l... (link reference for SCALAPACK, needed by MUMPS) 
# BLASLAPACK= -l... (link reference for LAPACK & BLAS) 
# MPIlib = -l... (link reference for MPI)

在我的Debian mpif.h發現：

MPIopt = -I/usr/lib/openmpi/include/ 
MPIlib = -lmpi

：

$ ls /usr/lib/openmpi/include/mpi.h 
/usr/lib/openmpi/include/mpi.h

所以我在Makefile中寫道：

但是從來沒有那麼少，當我嘗試編譯時，出現以下錯誤：

:~/AGMG_3.0/Example_par$ make 
cd ../SRC;make dpar 
make[1]: Entering directory `AGMG_3.0/SRC' 
make[1]: Nothing to be done for `dpar'. 
make[1]: Leaving directory `AGMG_3.0/SRC' 
gfortran-4.4 -O4 -o Example_par Example_par.o ../SRC/dagmg_par.o -lmpi 
Example_par.o: In function `MAIN__': 
Example_par.f90:(.text+0x77): undefined reference to `mpi_init_' 
.... 
.... 
.... 
dagmg_par.f90:(.text+0x19fc9): undefined reference to `mpi_comm_rank_' 
dagmg_par.f90:(.text+0x19fdd): undefined reference to `mpi_comm_size_' 
collect2: ld returned 1 exit status 
make: *** [Example_par] Error 1

我挺現在糊塗了，我不得不嘗試是成功的，但比我有scaplap 和其他要求的問題。 scalap發現：

$ dpkg -L libscalapack-mpi-dev 
/. 
/usr 
/usr/lib 
/usr/lib/libscalapack-openmpi.a

腮腺炎在/usr/lib/libsmumps.a發現，頭文件是/usr/include/smumps_c.h我

那麼，如何把這個一起？

我知道，對於一個更先進的FORTRAN或C語言開發，這將是微不足道的......提前

感謝您的幫助。

編輯：我把這裏全Makefile文件的定義，希望它可以幫助別人：

MPIopt = -I/usr/lib/openmpi/include -I/usr/lib/openmpi/lib -L/usr/lib/openmpi/lib -pthread 
MPIlib = -lmpi_f90 -lmpi_f77 -lmpi 
MUMPSPopt = -I/usr/lib/libsmumps.a -I/usr/lib/libdmumps.a 
MUMPSlib = -lsmumps -ldmumps 
BLASLAPACK=-L/usr/lib -llapack -lblas 
BLASLAPACK=-L/usr/lib -llapack -lblas 
SCALAP = -L/usr/lib/libscalapack-openmpi.a -lscalapack-openmpi 

F90=gfortran-4.6

這建立它。謝謝你的回覆！

來源

2012-03-05 Oz123

這些是鏈接器錯誤。它看起來像你的包含文件已被成功拾取，但鏈接程序沒有看到MPI庫。嘗試將MPIlib = -lmpi更改爲包含libmpi.a的路徑，例如MPIlib = -L/usr/lib/openmpi/lib -lmpi

或者，按照@haraldkl的建議，嘗試使用MPI編譯器包裝。這些應該自動連接到MPI。

來源

2012-03-05 22:09:24

謝謝！這告訴我如何去做！ -L/Path/to/Library.a -llibName！ – Oz123 2012-03-06 07:33:20

我想你錯過了Fortran MPI庫的東西。您應該使用安裝的mpi編譯器封裝，通常稱爲mpif90。如果你想指定手動所有的圖書館，你可以在由包裝器設置的選項一目瞭然與

mpif90 --showme

（對了openmpi）或一些類似的標誌，這取決於你的MPI庫。

來源

2012-03-05 21:48:07 haraldkl

感謝您的回答。雖然這向我展示了有關MPI的東西，但我仍然與其他庫很苦惱。另一個答案告訴我如何爲別人做，所以我接受了。 – Oz123 2012-03-06 07:32:04

編譯使用mpi的庫（AGMG）

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