RStudio中的Sweave無法找到在全局環境中加載的對象

Reading this post我以爲我可以直接在.Rnw文檔中使用在全局環境中加載的R對象，並直接在RStudio中將它們編譯爲PDF。但不幸的是，這並不適合我...RStudio中的Sweave無法找到在全局環境中加載的對象

我想作出summary的data.frame毫無疑問已經加載到我的全球環境。

在控制檯中評估summary(JLLdata)會產生正確的輸出。但是，當我嘗試在我的.Rnw文件中包含summary(JLLdata)時，出現錯誤(chunk 1) Object 'JLLdata' not found。

這裏我.Rnw語法：

\documentclass{article} 

\begin{document} 
\SweaveOpts{concordance=TRUE} 

<<JLLdata>>= 
summary(JLLdata) 
@ 

\end{document}

在這裏，來自R工作室的截圖（你可以看到JLLdata是在全球環境和編譯PDF錯誤）

enter image description here

來源

2015-03-31 Gui_struggling_with_R

的來自Sweave.Rnw文檔的代碼在單獨的R會話中運行，因此它無法訪問您在控制檯中加載或創建的對象。您必須在Sweave代碼塊中明確加載數據，以便在致電summary時可以訪問該數據。

來源

2015-03-31 19:57:12 Thomas

Thx @Thomas，你是對的。包括'load（file =「/path/globalenvironmnetsaved.RData」）'這樣的工作......這有點令人討厭的解決方案，因爲我的'.RData'大小爲200MB，因此編譯PDF需要一段時間。。 – 2015-03-31 20:30:10

請考慮使用knitr，它提供了一個緩存選項，大大減少了編譯時間。 – Thomas 2015-03-31 20:38:47

或者從命令行使用'Sweave（）'，因爲R本身具有靈活性，GUI按鈕的便利性不可避免地帶走了。也許寫一點實用功能來簡化這個過程，把它放在你的.R檔案或一個個人軟件包中，以便加載。例如：'sweave2pdf < - 函數（文件）texfile < - Sweave（file）; tools :: texi2pdf（texfile） }' – 2015-03-31 20:45:20

RStudio中的Sweave無法找到在全局環境中加載的對象

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