使用匹配的條目（shell腳本）

我有相同結構的兩個.csv檔案來使用匹配的條目（shell腳本）

ENSTGUG00000000001,C2CD2L 
ENSTGUG00000000002,DPAGT1 
ENSTGUG00000000003,EGR1 
ENSTGUG00000000004,REEP2 
ENSTGUG00000000005, 
ENSTGUG00000000006,PIAS2 
ENSTGUG00000000007,KDM3B 
ENSTGUG00000000008, 
ENSTGUG00000000010,HMBS 
ENSTGUG00000000011,

和

ENSTGUG00000000001, 
ENSTGUG00000000002,DPAGT1 
ENSTGUG00000000003,EGR1 
ENSTGUG00000000004,REEP2 
ENSTGUG00000000005, 
ENSTGUG00000000006,PIAS2 
ENSTGUG00000000007,KDM3B 
ENSTGUG00000000008,LOC100218573 
ENSTGUG00000000010,HMBS 
ENSTGUG00000000011,

我想找到的第一個文件的第1列元素爲其第二列爲空，並在第二個文件的第二列中查找相應的內容。

，使輸出將

ENSTGUG00000000001,C2CD2L 
ENSTGUG00000000002,DPAGT1 
ENSTGUG00000000003,EGR1 
ENSTGUG00000000004,REEP2 
ENSTGUG00000000005, 
ENSTGUG00000000006,PIAS2 
ENSTGUG00000000007,KDM3B 
ENSTGUG00000000008,LOC100218573 
ENSTGUG00000000010,HMBS 
ENSTGUG00000000011,

這樣我可以有第一檔儘可能完整。

來源

2017-09-13 Madza Yasodara Farias Virgens

你嘗試過這麼遠嗎？（通常情況下，如果某人表現出某種努力，就會在SO上得到更好的迴應。） – John1024

假設你的文件，一行行上線：

awk '{getline s < "file2.csv"; split(s, a, ",")} 
     !$2 && a[2] { $2 = a[2] }1' FS=, file1.csv

這甚至不是遠程穩健，如果你的文件不完全匹配將是完全沒有價值，但它給你的地方開始。

這是相當不言自明的...自然awk一次讀取一行輸入文件。每次讀取一行時，它都會執行腳本中的命令。在這種情況下，它從file2.csv中讀取一行並將其拆分爲,。然後檢查從file1.csv讀取的行的第二個字段是否爲布爾值爲false（因此，如果條目是整數0，則它們可能會被覆蓋），並且來自文件2的行中的第二個字段是非-零。如果這是真的，它將file2中的字段分配給當前輸入行的第二個字段。然後輸出該行。

來源

2017-09-13 23:37:36

AWK oneliner：

$ $ awk 'BEGIN{FS=OFS=","} NR==FNR{if($2!="")a[$1]=$2;next}{if($2=="")$2=a[$1]}1' input2.txt input1.txt 
ENSTGUG00000000001,C2CD2L 
ENSTGUG00000000002,DPAGT1 
ENSTGUG00000000003,EGR1 
ENSTGUG00000000004,REEP2 
ENSTGUG00000000005, 
ENSTGUG00000000006,PIAS2 
ENSTGUG00000000007,KDM3B 
ENSTGUG00000000008,LOC100218573 
ENSTGUG00000000010,HMBS 
ENSTGUG00000000011,

解釋：

BEGIN{FS=OFS=","}  # set field-separator and output field-seperator to a "," 

NR==FNR{    # for the first input file 
    if ($2!="")   # if $2 is not an empty string 
    a[$1]=$2;  # save $2 in array a with index $1 
    next    # skip to next line to read 
} 
{ 
    if ($2=="")   # if $2 is empty string 
    $2=a[$1]   # replace it with the save value in array a 
}1

來源

2017-09-14 05:15:34

您需要'awk'BEGIN {FS = OFS =「，」} ...' – RomanPerekhrest

@RomanPerekhrest號。命令行有一個-F，其中設置了FS。這裏不需要OFS。 –

錯誤，請再次查看問題 – RomanPerekhrest

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