我有一個約20個元素的距離矩陣，我正用它來在R中進行分層聚類。有沒有一種方法可以用一個圖或圖片來標記元素，而不僅僅是數字，字符等？分層集羣標記的情節

因此，代替具有數字的葉節點，它會有小塊圖或圖片。

這就是爲什麼我對這個功能感興趣。我有這樣的2-d散點圖（顏色表示密度）

http://www.pnas.org/content/108/51/20455/F2.large.jpg（請注意，這不是我自己的數據）

我來分析幾百個這樣的2-d散點圖，並正嘗試了各種距離度量，我正在喂hclust。這個想法是快速（儘管粗略地）將2-D圖分組以找出更大的圖案，因此我們可以最小化耗時的後續實驗的次數。因此，用適當的2-D圖標記樹狀圖葉子是理想的。

2012-12-13 Asker

你試過了什麼？你可以添加一個可重複的例子。這可以幫助你http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example – agstudy

@ flodel如果你讀了這個問題，我想標記葉子的情節。我不想使用字符串或顏色，因爲我正在按照模式對二維散點圖進行聚類，所以我想要小圖片。 – Asker

@agstudy謝謝，不幸的是，我之前沒有在R中看到過這個，這就是爲什麼我問。基本上，我有這樣的數據（這不是我的數據，順便說一句）：http://www.pnas.org/content/108/51/20455/F2.large.jpg顏色表明密度...除了我有數以百計的這些，我試圖將它們聚類在一起，以便我可以快速評估不同類別的行爲......並且將樹狀圖標記爲適當的地塊非常有幫助。 – Asker

有一個選項：

使用as.dendrogram
使用dendrapply在樹中應用功能將您的hclust。該功能定製葉。

這裏是一個例子，其中我爲我的羣集着色，並且改變了節點的chape。

hc = hclust(dist(mtcars[1:10,])) 
hcd <- as.dendrogram(hc) 
mycols <- grDevices::rainbow(attr(hcd,"members")) 
i <- 0 
colLab <- function(n) { 
    if(is.leaf(n)) { 
     i <<- i + 1 
     a <- attributes(n) 
     attr(n, "nodePar") <- 
     c(a$nodePar, list(lab.col = mycols[i],lab.bg='grey50',pch=sample(19:25,1))) 
     attr(n, "frame.plot") <- TRUE 
    } 
    n 
    } 
clusDendro = dendrapply(hcd, colLab) 
# make plot 
plot(clusDendro, main = "Customized Dendrogram", type = "triangle")

enter image description here

想法：

如果試圖自定義節點標籤給它的地圖的網址鏈接。所以當你點擊葉子名稱時，你可以導航到它的圖像。我認爲這並不難。

來源

2012-12-13 02:42:02 agstudy

非常感謝您的支持，我使用了您的鏈接中的A2R代碼 – Asker

分層集羣標記的情節

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