將三個文件的內容合併爲一個

-1

a1.txt

>1BS3 
MDEKRRAQH 
>2ERT 
>3a56 
NEVE

a2.txt

>1BS3 
QSKGGILS 
>2ERT 
INNWIV 
>3a56 
RRRRDK

a3.txt

>1BS3 
>2ERT 
PDSSM 
>3a56 
ILSKASDYIQELRQSNHR

我想上述三個文件合併到另一個文件anew.txt。我怎樣才能做到這一點？

所需的輸出

>1BS3 
MDEKRRAQHQSKGGILS 
>2ERT 
INNWIVPDSSM 
>3a56 
NEVERRRRDKILSKASDYIQELRQSNHR

我想獲得上述順序輸出。

來源

2014-02-13 user3305627

注意這些AWK答案使用關聯數組見過的鑰匙。迭代數組的鍵時沒有固有的順序。如果這對你很重要，請告訴我們。 –

非常感謝您的評論。固有順序對我來說很重要。 – user3305627

這awk程序保持鍵的順序。它保存在一個數字索引數組

awk ' 
    /^>/ { 
     key = $0 
     if (!(key in val)) { 
      keys[++n] = key 
      val[key] = "" 
     } 
     next 
    } 
    { val[key] = val[key] $0 } 
    END { 
     for (i=1; i<=n; i++) { 
      print keys[i] 
      print val[keys[i]] 
     } 
    } 
' a{1,2,3}.txt

>1BS3 
MDEKRRAQHQSKGGILS 
>2ERT 
INNWIVPDSSM 
>3a56 
NEVERRRRDKILSKASDYIQELRQSNHR

來源

2014-02-13 15:44:06

非常感謝。 – user3305627

這awk應該做的：

awk '!/^>/ {a[s]=a[s] $0} {s=$0} END {for (i in a) print i RS a[i]}' a1 a2 a3 
>2ERT 
INNWIVPDSSM 
>1BS3 
MDEKRRAQHQSKGGILS 
>3a56 
NEVERRRRDKILSKASDYIQELRQSNHR

來源

2014-02-13 11:29:34 Jotne

事情是這樣的：

awk '/^>/{sel=$0;next}{a[sel]=a[sel]$0}END{for (i in a) print i RS a[i]}' a[123].txt

，說，如果第一個字符是「>」，設置記錄選擇（我的「SEL」變量）到當前行，並忽略其餘的處理。如果該行不以「>」開始，則將當前行添加到當前選定的行。最後，將所有內容打印出來。

輸出示例：

>3a56 
NEVERRRRDKILSKASDYIQELRQSNHR 
>1BS3 
MDEKRRAQHQSKGGILS 
>2ERT 
INNWIVPDSSM

來源

2014-02-13 11:31:16

不知道爲什麼，我得到所有輸出在長隊，而不是在我的職位6。 – Jotne

發現錯誤，你需要刪除'/^\> /'中的「\」並將其設置爲'/ ^> /' – Jotne

嗯，怪怪的！不知道爲什麼會這樣，但感謝您進行測試。 –

將三個文件的內容合併爲一個

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