導入Cytoscape桌面3.1測試版導出JSON文件（.cyjs）到Cytoscape.js

我從Cytoscape 3.1測試版3使用內置導出器導出到JSON（cyjs）文件中導出了蛋白質蛋白質網絡。我試圖使用Cytoscape.js庫將這個cyjs文件導入到Web應用程序，但是我失敗了。導入Cytoscape桌面3.1測試版導出JSON文件（.cyjs）到Cytoscape.js

我昨天讀了gcpdev問的問題（Exporting and importing JSON data to Cytoscape.js），但它對我沒有幫助。

導入的JavaScript庫：jQuery-1.11，Cytoscape.js，Arbor，Arbor-tween。我的代碼是：

<script type="text/javascript"> 

$('#cy').cytoscape({ 
    layout: { 
    name: 'arbor', 
    liveUpdate: true, 
    }, 

    ready: function(){ 

    window.cy = this; 
    var jsonfile = "src/inside_sc.cyjs"; 

    $(document).ready(function() { 

     $.getJSON(jsonfile, function(json) { 
     cy.add(JSON.parse(json)); 
     }); 

    }); 

    } 
}); 

</script>

我總是得到一個錯誤消息，這樣在Chrome控制檯：

Uncaught SyntaxError: Unexpected token o  index.html:38 
    (anonymous function)      index.html:38 
    j           jquery-1.11.0.min.js:2 
    k.fireWith         jquery-1.11.0.min.js:2 
    x           jquery-1.11.0.min.js:4 
    b           jquery-1.11.0.min.js:4

其中的index.html是我的文件和行：38：

cy.add(JSON.parse(json));

我得到了相同的錯誤消息，並進行了更改。如果我添加一些樣式和基本節點邊緣，也不能使用$.parseJSON()函數。

我想這行更改爲cy.add(json);結果是像上面提到的問題是相同的：

An element must be of type `nodes` or `edges`; you specified `undefined` 
Uncaught TypeError: Cannot read property 'single' of undefined

當我嘗試顯示JSON信息到控制檯，像console.log(json);它工作正常。

我的腳本有什麼問題？我該怎麼辦？

來源

2014-02-11 zoliqa

據我所知，從Cytoscape-desktop導出的JS不是替代cy.add()或init選項的替代品。您需要檢查由Cytoscape-desktop生成的文件，並在init選項（options.elements）中指定JSON中元素的路徑。

來源

2014-02-11 16:21:44 maxkfranz

對不起，但我是應用程序開發的初學者，我不太瞭解。那麼，我應該怎樣編碼才能將一個簡單的CyDesktop導出轉換爲真正的CyJS網絡？我怎樣才能實現元素對象的新元素？ – zoliqa

您需要使用'options：{elements：json.path.to.elements}'或類似內容，其中'path.to.elements'是從Cytoscape導出的指向元素的JSON中的路徑。 – maxkfranz

@maxkfranz我有一個變量'newdata'，它包含一個指定'elements'的字符串。在'$（'＃cy'）。cytoscape（{'我可以做'elements：newdata'？ –

導入Cytoscape桌面3.1測試版導出JSON文件（.cyjs）到Cytoscape.js

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