如何在R包中處理掩蓋衝突的正確方法？

我不知道如果衝突的軟件包不是我自己的軟件包，處理掩蔽的最佳方式是否正確地衝突。考慮下面的例子。我在時間系列上工作了很多，並且通常會使用像季度，年份等函數名。所以如果我加載tis和data.table R的功能顯然取決於程序包加載的順序。如何在R包中處理掩蓋衝突的正確方法？

library(tis) 
library(data.table) 
# this masks: between, month, quarter, year 
library(TSfame) # loads TSdbi 
con <- TSconnect("somefame.db") 
# the following fails when data.table was loaded after tis 
ts1 <- TSget("somekeyInYourDB",con)

和012get包中的TSget不再有效。我是否需要分叉包並實現一些::語法？這個例子可能是特定的，但問題很普遍。更有經驗的用戶會做什麼？

編輯：可能我需要更清楚地說明這一點。問題在於我沒有機會明確地調用該函數，因爲TSget正在調用應明確調用的函數，並假定只有這個函數。

EDIT2，將調用堆棧的要求由任賢齊棉花：

Tracing year(actualStart) on entry 
[[1]] 
TSget("kofbauindikator_total", con) 

[[2]] 
    TSget("kofbauindikator_total", con) 

[[3]] 
.local(serIDs, con, ...) 

[[4]] 
    getfame(serIDs[i], dbname[i], save = FALSE, envir = parent.frame(), 
    start = NULL, end = NULL, getDoc = FALSE) 

    [[5]] 
    year(actualStart) 

    [[6]] 
    .doTrace((function() 
    print(sys.calls()))(), "on entry") 

[[7]] 
eval.parent(exprObj) 

[[8]] 
eval(expr, p) 

[[9]] 
eval(expr, envir, enclos) 

[[10]] 
(function() 
    print(sys.calls()))() 

Error in as.POSIXlt.default(x) : 
    do not know how to convert 'x' to class 「POSIXlt」

來源

2014-10-20 Matt Bannert

我在這裏丟失了一些東西，因爲'TSget'不會調用任何衝突函數的'quarter'。問題（1）'TSfame'中的函數在'tis'中調用函數，但您希望它調用'data.table'中的函數，或者（2）'TSfame'中的函數有時調用函數在'tis'中，有時會在'data.table'中調用一個函數，具體取決於'search（）'路徑嗎？ – 2014-10-20 10:20:35

問題是'TSget'確實會調用'quarter'或任何相沖突的函數。如果我不加載data.table在所有的一切工作。如果我調用data.table，則會調用這4個屏蔽函數中的一個，而不是調用tis函數。所以2）實際上正是我的問題。 – 2014-10-20 10:29:58

我有一個預感，問題可能是'TSfame'應導入'TSdbi'而不是根據它（請參閱http://stackoverflow.com/q/8637993/134830），但請您提供一個示例，以再現問題，以便更容易確認這一點。 – 2014-10-20 10:34:57

調用堆棧顯示，曖昧地命名功能，year，被稱爲getfame。 getAnywhere("getfame")顯示這在fame包中找到。

packageDescription("fame")顯示fame取決於tis而不是導入它，這是問題所在。正如here所建議的那樣，向包裹維護者（Jeff Hallman）發送電子郵件是一個好主意，要求他將依賴關係更改爲導入。這可能需要一些包裝改造的，所以你也可以建議改變路線

startYear <- as.integer(year(actualStart))

在 getfame

的短期修復到

startYear <- as.integer(tis::year(actualStart))

（可能還有其他的像這樣的必要的修改。）

在您等待維護人員修復時，您可以使用assignInNamespace覆蓋該功能。也就是說，在加載包之前，輸入

assignInNamespace(
    "getfame", 
    function(sernames, db, connection = NULL, save = FALSE, envir = parent.frame(), 
    start = NULL, end = NULL, getDoc = TRUE) 
    { 
    # your fixed function definition with tis::year 
    }, 
    "fame" 
)

來源

2014-10-20 12:33:49

+1非常感謝，我想我提出了一些類似於你過去對他的快速解決方案。有什麼我可以做，但等待維護者，因爲這是這樣的利基產品？你能詳細解釋一下'assignInNamespace'嗎？但回到我原來的問題：這是否意味着：等待包維護者是這裏的方式？ – 2014-10-20 12:39:22

要麼你使用'assignInNamespace'來重寫'getfame'，要麼你分叉包並保留整個事物的副本（可能公開託管fork以便其他人可以使用它），或者說服現有的維護者修復他包。 – 2014-10-20 13:06:28

最後回到這個補丁，並使用你的想法工作......所以非常感謝！剩下的問題是追捕幾個沒有從名氣輸出的功能，所以我不得不爲名人命名::: functionname，但是這個https://gist.github.com/mbannert/6584c3aa765648b987c3作品 – 2015-02-11 21:14:20

如何在R包中處理掩蓋衝突的正確方法？

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