重新排序行文件

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我想知道是否有重新安排在一個文件中的行的方式：重新排序行文件

我有一些原子座標文件，在一條線上的每個原子，我需要一些原子寫在別人面前。假設：

atom c1 
atom c2 
atom c3

我需要重新排序行數。例如：

atom c2 
atom c1 
atom c3

有沒有辦法做到這一點沒有列表？

即使創建一個列表，我沒有成功。最後的審判是：

i = open("input.pdb", "r") 
o = open("output.pdb", "w") 
l = [] 
for line in i: 
    l. append(line.split()) 
    for line in l: 
     if "atom c2" in line: 
     a = l.index(line) 
     b = int(a) -1 
     l[a] = l[b] 
for line in l: 
    0.write("{}\n".format(line)) 
o.close() 
os.remove("input.pdb")

任何想法？

來源

2014-02-17 user3320927

你應該發佈整個家庭作業練習 – leon

'0.write'？你的意思是'o.write'？ – Blorgbeard

如果這是您的代碼縮進的方式，那麼if：原子c2在行中：block是空的，其後的所有代碼將始終執行。 – IanAuld

比方說，你既然沒有給出其他指示，你事先知道什麼順序線應該被寫入。

atom c1 # line 0 
atom c2 # line 1 
atom c3 # line 2

在你的榜樣，那將是1, 0, 2。然後，而不是for line in l（另外，請never name a variable "l"!），你可以反過來遍歷你的行索引列表，並寫每個相應的行。

with open("input.pdb", "r") as infile: 
    lines = [line for line in infile] # Read all input lines into a list 

ordering = [1, 0, 2] 
with open("output.pdb", "w") as outfile: 
    for idx in ordering: # Write output lines in the desired order. 
     outfile.write(lines[idx])

來源

2014-02-17 22:36:14

重新排序行文件

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