請問Pymol是否允許用戶通過用戶定義的值設置原子顏色？ 例如，我想通過它們的生物化學特徵對所有原子着色，羽毛被認爲是RGB值，比方說[R G B]等於[feature1特徵2特徵3]，我怎樣才能在Pymol中做到這一點？如何在Pymol中設置RGB顏色
另外，如果我已經對原子着色了，我可以得到顏色值嗎？我嘗試使用cmd.getcolor（），但它返回的值不被識別爲RGB顏色，Pymol中是否還有其他任何可用於獲取原子顏色的函數 ？
請參閱pymolwiki頁面Color和Set Color。
首先，定義一組的使用特徵（記住正常化您的特徵值成比例[0,1]，或[0,255]）顏色：
set_color mycol1, [feature1R, feature1G, feature1B]
set_color mycol2, [feature2R, feature2G, feature2B]
...
然後，可以着色的原子使用自定義顏色：
# color all alpha Carbons to mycol1:
color mycol1, n. CA
# color all backbone Nitrogens to mycol2:
color mycol1, n. N
要獲得原子顏色，請參閱「Getting Atom Colors」。 假設你有一個名爲youratom原子和你想要得到的顏色吧：
atomcolor = []
iterate youratom, atomcolor.append(cmd.get_color_tuple(color))
print atomcolor[0]
atomcolor[0]是規模[0,1]與RGB值的元組。