在lm（y〜。）中點的含義R

我想在別人寫的代碼中理解R中這個語句的含義。在lm（y〜。）中點的含義R

mymodel = lm(gene ~ ., data = mydata)

mydata如下：

> mydata 
       gene cna rs11433683  PC1 PC2 
TCGA.BH.A0C0 270.7446 0.1291   0 270.7446 0.1291 
TCGA.A2.A3XY 87.9092 0.0128   1 87.9092 0.0128 
TCGA.XX.A89A 255.1346 0.1530   1 255.1346 0.1530

我已經通過R幫助部分找到如何.解釋。據我所知，.通常不使用，但是這是我發現

help(formula)

有一個公式中的.兩個特殊的解釋。通常的之一是在模型擬合函數的參數data的上下文中，並且意味着'公式中沒有其他所有列'：參見 terms.formula。在update.formula上下文中，僅，它意味着「什麼是先前在公式中該部分」

help(terms.formula)

AllowDotAsName：在公式中通常.是指包含在其餘變量data。例外情況下，.可被視爲名稱，用於公式的非標準用途。

data：數據幀，從中可以推斷出特殊符號.的含義。如果公式中沒有.，則不使用。

但是，我不太確定這些陳述的意思。有人可以給我一個簡單的例子，說明我在上面提到的陳述和數據中的含義嗎？

來源

2017-08-12 alpha_989

https://stats.stackexchange.com/questions/10712/what-is-the-meaning-of-the-dot-in-r –

這意味着使用所有其他變量（cna，rs ...，pc1和pc2）作爲模型中的獨立變量。 – ayhan

它正是它所說的：「所有列」（來自提供給'data'參數的數據）''不在公式中'。在這種情況下，由於提供了「基因」，其餘部分被作爲解釋變量，所以'基因〜'相當於'基因〜cna + rs11433683 + PC1 + PC2'。儘管如此，解釋只會到目前爲止;嘗試一下，看看結果模型的差異。 – alistaire

在模型擬合函數的數據參數的情況下
，並表示「所有列，否則不會在公式中」

正是它說有包裝盒上的！

因此，與

mymodel = lm(gene ~ ., data = mydata)

你得到比gene這是在mydata對公式的RHS每個變量其他：

cna + rs11433683 + PC1 + PC2

據我所看到的，所引用的語句是清楚明確（...但你也可以看到它只是從幾個小例子中看出來）

唯一可能不明顯的是如果您沒有提供data參數（但在terms.formula的引用中回答了您的報價中的答案），它會發生什麼。

來源

2017-08-13 02:23:54

我同意，事後看來，引用的文字看起來很清楚，只要我看到這個例子。然而，「通常的一個是在模型擬合函數的數據論證的背景下，意味着'公式中沒有其他所有列'：參見terms.formula」並不一定會引導讀者理解y〜。相當於y〜a + b + c ...其中a，b，c是其他數據列，特別是如果它們是新的字段。幫助部分是用密集文本編寫的，並且已經與R高度熟悉。 –

-1

意味着你比較基因所有變量的

來源

2017-08-13 02:31:29 ZWL

在lm（y〜。）中點的含義R

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