SLURM squeue格式參數在子進程中失敗.Popen

我試圖從python腳本調用SLURM squeue。該命令，SLURM squeue格式參數在子進程中失敗.Popen

/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft

命令行

工作正常，但是從subprocess.Popen失敗：

p = subprocess.Popen(command, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE) 
    File "/n/home00/DilithiumMatrix/.conda/envs/py35/lib/python3.5/subprocess.py", line 947, in __init__ 
    restore_signals, start_new_session) 
    File "/n/home00/DilithiumMatrix/.conda/envs/py35/lib/python3.5/subprocess.py", line 1551, in _execute_child 
    raise child_exception_type(errno_num, err_msg) 
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft'

MWE：

import subprocess 
command = "/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft" 
p = subprocess.Popen(command, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE) 
text = p.stdout.read() 
print(text)

/usr/bin/squeue工作正常，無論從命令行或Popen。

它可能會失敗，因爲它需要一些關於執行squeue命令的用戶/組的信息，並且在通過python運行時（以某種方式）會丟失？還有什麼可能導致這種情況？

來源

2016-12-19 DilithiumMatrix

你對'subprocess.Popen'的調用是什麼樣的？它如何失敗？ –

@MarkkuK。 woops，對不起--- MWE和錯誤信息包括在內。 – DilithiumMatrix

您需要將您的命令作爲字符串列表傳遞：'command = [「/ usr/bin/squeue」，「--Format = username，jobid，name，timeleft」]' –

subprocess.Popen的第一個參數是一個字符串或一個字符串列表。如果它是一個字符串，它將被解釋爲一個文件名。這是你得到錯誤的原因。要傳遞一個字符串列表，它應該匹配shell如何將參數傳遞給進程。一個標準的外殼會分裂以空白的命令行，所以不是這樣的：

command = "/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft"

你需要這樣的：

command = ["/usr/bin/squeue", "--Format=username,jobid,name,timeleft"]

分裂的第二個參數在「=」當你在你的評論中提及剛混淆squeue，然後會看到兩個參數。

來源

2016-12-19 22:35:06

SLURM squeue格式參數在子進程中失敗.Popen

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