無法使用php執行命令行

Question

我試圖運行本地BLAST的命令行。我已經下載了軟件包並允許每個文件和文件夾的權限。但是我仍然無法在頁面上顯示它的輸出。

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa -evalue 10 "); 

希望任何人都可以幫助我。

Answer 1

shell_exec只會返回標準輸出。寫入STDERR的任何錯誤消息都將丟失，除非您在命令末尾添加2>&1。這會將寫入到STDERR（文件描述符＃2）的任何內容重定向到STDOUT（文件描述符＃1），該文件將由shell_exec返回並由echo顯示。所以，試試這個...

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp" 
    . " -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh" 
    . " -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa" 
    . " -evalue 10" 
    . " 2>&1" 
);