pydicom：數據集沒有屬性 'TransferSyntaxUID'

嗨，我是從閱讀DICOM文件與pydicompydicom：數據集沒有屬性 'TransferSyntaxUID'

這個職位的痛苦不同於 pydicom 'Dataset' object has no attribute 'TransferSyntaxUID'

這裏是我的代碼

import dicom 
dicom.read_file(file,force=True)

這導致錯誤

 AttributeError       Traceback (most recent call last) 
    <ipython-input-32-a32aef2d2178> in <module>() 
    ----> 1 dicom.read_file(raw_path + pat_lst[0] + '\\' + pat_dcm_lst[0],force=True) 

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_file(fp, defer_size, stop_before_pixels, force) 
     612  try: 
     613   dataset = read_partial(fp, stop_when, defer_size=defer_size, 
    --> 614        force=force) 
     615  finally: 
     616   if not caller_owns_file: 

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\filereader.pyc in read_partial(fileobj, stop_when, defer_size, force) 
     520  if preamble: 
     521   file_meta_dataset = _read_file_meta_info(fileobj) 
    --> 522   transfer_syntax = file_meta_dataset.TransferSyntaxUID 
     523   if transfer_syntax == dicom.UID.ImplicitVRLittleEndian: 
     524    pass 

    D:\Program Files\Anaconda2\lib\site-packages\dicom\dataset.pyc in __getattr__(self, name) 
     254   if tag not in self: 
     255    raise AttributeError("Dataset does not have attribute " 
    --> 256         "'{0:s}'.".format(name)) 
     257   else: # do have that dicom data_element 
     258    return self[tag].value 

    AttributeError: Dataset does not have attribute 'TransferSyntaxUID'.

I t匿名時出現錯誤。我想知道爲什麼會發生這種情況。

正在刪除與DICOM標準相關的TransferSyntaxUID？

而且，我可以通讀MATLAB，VTK，ITK但pydicom

所以，現在我想要做的是設置TransferSyntaxUID通過SimpleITK手動和通過pydicom再次讀取。

，我會讓你知道什麼時候該工作

在此先感謝

來源

2017-09-05 JessieB

的pydicom庫有一個更新是寬容缺失轉移語法。作爲一種解決方法，直到下一個版本，你可以修改filereader.py中的幾行，如圖所示here

來源

2017-09-05 03:59:35 darcymason

嗨達西，感謝您的回答，我會檢查您鏈接的pydicom問題，我會讓你知道的 – JessieB

從我對DICOM標準的理解看來，Transfer Syntax UID（0002,0010）是一個強制標記。這是一個type 1 tag它指示它is required。

雖然這是標準所說的，但即使缺少這個標籤，庫仍然可以讀取這些文件。我猜這是因爲該標準還定義了一個default transfer syntax。

關於使用SimpleITK設置值，這應該肯定有效。此外，如果您需要驗證您的文件符合標準，則可以使用David Clunie的dicom3tools，特別是dciodvfy和dcdump。

來源

2017-09-05 14:54:37 zivy

HI zivy，是謝謝你的回答，我同意你的觀點，即Transfer Syntax是強制性的，但我想知道DICOM標準中的匿名協議允許使用空傳輸語法，正如PS 3.15中的表E.1-1所述。 [PS.3.15 pdf]（http://dicom.nema.org/medical/dicom/current/output/pdf/part15.pdf） – JessieB

嗨JessieB，不幸匿名化超出了我的DICOM專業知識。鑑於匿名數據不適用於患者治療，我對DICOM規範之後的匿名者持懷疑態度。我懷疑他們不遵循標準是很常見的（只是基於個人對軟件開發經驗的看法）。 – zivy

pydicom：數據集沒有屬性 'TransferSyntaxUID'

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