itk

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我試圖從3D數組中獲取圖像並將其轉換爲TIF 3D。我正在使用簡單的ITK，但它不起作用。我得到這個錯誤信息：「的方法 'WriteImage'，參數1型 'ITK ::簡單::圖片常量&' 這裏是我的代碼： import numpy as np import SimpleITK as sitk test = np.ones((20,20,20)) sitk.WriteImage(tes

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不能寫圖像SimpleElastix（蟒蛇）

我試圖運行下面的示例作爲SimpleElastix庫的一部分： import SimpleITK as sitk elastixImageFilter = sitk.ElastixImageFilter() elastixImageFilter.SetFixedImage(sitk.ReadImage('1.jpg', sitk.sitkFloat32)) elastixImageFilt

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如何使用simpleitk獲取反向位移字段

我剛剛從matlab移動到Python最近，所以我可以使用simpleitk和抱歉，如果這是一個愚蠢的問題。我使用simpleitk進行惡魔註冊之後有一個轉換tx。我希望通過執行以下操作來獲得位移場及其逆， disp_field = tx.GetDisplacementField() disp_field_inv = tx.GetInverseDisplacementField() 原來d

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爲什麼ConnectedThresholdImageFilter類不在閾值內標記像素？

我想使用ConnectedThresholdImageFilter類來分割二進制圖像（'slice87.jpg'）的「C」看白色區域。這個想法是選擇一個位於該區域內的種子值，並且只添加也具有255強度的相鄰像素（在閾值254和256之間）。然而，我的代碼的結果的圖像中的與每一個像素設置爲0：代替此（通過Photoshop的手動編輯）：我的種子值是（x，y）=（115,35）。 img.Get

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pydicom：數據集沒有屬性 'TransferSyntaxUID'

嗨，我是從閱讀DICOM文件與pydicom 這個職位的痛苦不同於 pydicom 'Dataset' object has no attribute 'TransferSyntaxUID' 這裏是我的代碼 import dicom dicom.read_file(file,force=True) 這導致錯誤 AttributeError Traceback (most rec

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使用Python中的SimpleITK讀取mhd文件時出錯

我在這裏再次討論關於python中的SimpleITK的另一個問題。我想繪製一個.mhd圖像，但我不知道如何。我想在這裏說明Reading *.mhd/*.raw format in python功能： load_itk('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd') 但它不是讀取圖像： RuntimeError: Exce

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將3D Numpy陣列放入ITK SNAP

如何將3D Numpy陣列（代表醫療數據的視頻）轉換爲適合ITK-SNAP應用程序進行手動分割的適當文件格式？

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CMake錯誤：ItkVtkGlue

我建VTK-8.0.0（使用msvc2017_64）和ITK-4.12.0（使用msvc2017_64）。在ITK - 建造如下： 1）構建VTK（CMake3.9.0） 2）構建ITK（CMake3.9.0）：Module_ITKVtkGlue + VTK_DIR this path C:\VTK\8.0.0\build\msvc2017_64 3）VTK使用msvc2017編譯（在釋放模式）

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使用二進制掩碼獲取感興趣的區域itk

我對ITK來說很新，因此幾乎沒有使用它的經驗。我的問題是：我有兩個nifti圖像：一個醫學圖像和一個代表感興趣體積的二進制圖像。我想從醫學圖像中只提取感興趣區域的區域。我想將該區域的強度值存儲在多維數組中。直到現在我讀取圖像和掩碼並將其值存儲在多維數組中。我現在可以逐個像素地比較這些值，但我希望可能有更簡單的方法？

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ITK嘗試註冊ImageIOFactory時出現錯誤

我試圖鏈接到ITK以使用VS2012（ITK版本4.11）讀取/寫入圖像。我用cmake構建了ITK庫;然後安裝到安裝前綴文件夾中。我已經使用了/包括文件夾中的附加在自己的項目文件夾和也使用了以下庫作爲附加的依賴關係： itksys-4.11.lib itkv3p_netlib-4.11.lib itkvnl_algo-4.11.lib itkvnl-4.11.lib ITKCommon-