如何在繪製橢圓時停止連接所有點的ggplot2？

我有一個非常惱人的問題，用ggplot2繪製橢圓，我想知道有沒有人能看到我做錯了什麼？所有點連接起來！如何在繪製橢圓時停止連接所有點的ggplot2？

我通常使用標準plot（）和ordiellipse（）來做到這一點，但一直試圖使用ggplot作爲可愛，但會發生這種情況。我會承認從互聯網上收集'for循環'代碼，但我看不到它中的錯誤。

這就是我得到： Conjoined NMDS points

我這樣做：

## The NMDS coords have been pre-calculated, and the file looks like this: 
    NMDS1 NMDS2 Site Species 
Sample.1 -0.390516864 -0.227890627 1 Lr 
Sample.2 -0.433137678 -0.221231786 1 Al 
Sample.3 -0.16384753 0.243258745 1 Lt 
Sample4 -0.444995027 -0.174555074 1 Ac 
Sample.5 -0.569417948 -0.223738264 2 Lr 
Sample.6 -0.543744761 -0.234924777 2 Lt 
.......etc 

# Code 
all <-read.table("/Users/Dan/Downloads/all.txt", header=TRUE) 
df_ell <- data.frame(x=all$NMDS1, y=all$NMDS2, group=all$Species) 

for(g in levels(all$Species)){ 
    df_ell <- rbind(df_ell, cbind(as.data.frame(with(all[all$Species==g,], ellipse(cor(NMDS1, NMDS2), scale=c(sd(NMDS1),sd(NMDS2)), 
    centre=c(mean(NMDS1),mean(NMDS2))))),group=g))} 

# Generate plot 
p <- ggplot(all, aes(NMDS1, NMDS2)) 

# plot it 
p + geom_point(size = 4, alpha=.8, aes(colour = factor(Species), shape = factor(Site))) + geom_path(data=df_ell, aes(x=x, y=y, colour=group), size=1, linetype=1)

來源

2014-03-19 Daniel

在for循環中創建df_ell，df_ell應該開始爲空，而不是在數據的副本all，否則您會將all中的數據添加到每個橢圓，這就是爲什麼它們顯示爲路徑的一部分。

來源

2014-03-19 16:08:43 BrodieG

謝謝！當你指出這一點時，這一點非常明顯！我不敢相信我沒有看到它。很感激。 – Daniel

如何在繪製橢圓時停止連接所有點的ggplot2？

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