R：如何在pheatmap中設置p爲minkowski距離？

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在R中，有一個函數可以生成具有樹狀圖的熱圖，稱爲pheatmap::pheatmap。 minkowski是pheatmap繪製樹狀圖的距離測量選項之一。但是，如何設置功能pheatmap中的p（閔可夫斯基距離的功率）？R：如何在pheatmap中設置p爲minkowski距離？

謝謝。

來源

2017-06-15 WCMC

如果你閱讀文檔更加緊密，你會得到的是@lebelinoz發佈點。 https://cran.r-project.org/web/packages/pheatmap/pheatmap.pdf – Masoud

你的意思是這個？ '＃從距離矩陣中指定聚類 drows = dist（test，method =「minkowski」）; （d（test），method =「minkowski」）; pheatmap（test，clustering_distance_rows = drows，clustering_distance_cols = dcols）' – WCMC

確切地說。 dcol和drows是在pheatmap之外定義的。 – Masoud

閔可夫斯基距離與pheatmap包無關。它是stats包中的dist函數的一部分。如果您嘗試?dist，你會看到dist有p參數專爲攝影距離的方法，明可夫斯基：

dist(x, method = "minkowski", p = 2)

來源

2017-06-15 21:52:35 lebelinoz

我的理解是'pheatmap'在內部使用'dist'函數繪製樹狀圖。但是，我無法找到如何在'pheatmap'中設置'dist'中的參數'p'。 – WCMC

'dist'不是'pheatmap'的一部分。它來自'stats'軟件包，當我使用不同的軟件包繪製熱圖時，我會使用它。 – lebelinoz

R：如何在pheatmap中設置p爲minkowski距離？

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