pheatmap

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    pheatmap - cytokine_annotation

    我試圖在下發展pheatmap cytokine_annotation和seq.int得到錯誤消息 錯誤（RX [1L]，RX [2L]，length.out = NB）： '從' 必須是 有限 ř版本3.3.3 pheatmap_1.0.8 重現的例子： #Using cytokine annotations M<-matrix(rnorm(8*20),ncol=8) row_annotat
    r pheatmap 2017-09-25

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    使用pheatmap時裁剪的列標籤

    我正在使用pheatmap（Documentation）繪製熱圖。我在一個相當簡單的方法繪製一個矩陣： pheatmap(mat, annotation_col=df, labels_col=rld$Infection_Line, fontsize_row=5, fontsize_col=7) 我圖的底部被截斷，使我無法看到列名在底部。它看起來像這樣： 請注意，這不是heatmap.2。 我試
    r plot pheatmap 2017-06-22

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    在排列中使用pheatmapGrid

    我試圖在使用arrangeGrob（）的同一個.jpg中繪製兩個圖。 我只是剛開始學習網格和grobs，我想我知道問題是什麼：pheatmap是一個網格對象，幷包含grob對象，不允許我把它放在arrangeGrob。這是真的？ 我會以某種方式將qplot放入網格中，並將pheatmap放入網格中，然後將這些網格放入新網格中？ library(grid) library(gridExtra)
    r grob pheatmap 2016-09-20

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    的R - 圖例標題或使用Pheatmap

    當我使用pheatmap創建值的熱圖，願與矩陣中的Z值單位標註圖例單位。在這個例子中，我希望圖例頂部的溫度[°C]。我已經閱讀了pheatmap的guidelines here，看起來圖例的唯一操作是添加一個默認數字列表來代替縮放比例。我看不到任何添加圖例標題的選項。 這裏是代碼的通用塊使用pheatmap以生成矩陣和情節。我真的很感激任何關於如何給圖例添加標題的建議。 test <- matri
    r heatmap pheatmap 2016-04-25

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    重新分類數據

    我已經使用pheatmap製作矩陣，需要能夠將其重新分類爲8個分類。任何幫助將不勝感激，我已經下面的代碼。 pheatmap(y, cluster_row=FALSE, cluster_col=FALSE, display_numbers=TRUE, color=colorRampPalette(rev(brewer.pal(n=10,name="RdYlBu")))(8)) 我曾
    r matrix classification raster pheatmap 2017-04-11

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    對於低於和高於閾值的值，使用自定義色標的熱圖貼圖

    我想使用顏色爲綠色，黑色和紅色的pheatmap製作R中的熱圖，並使用範圍從-2到2的圖例，這裏是碼，我用： library(pheatmap) my_palette <- colorRampPalette(c("green", "black", "red"))(n = 201) colors = c(seq(as.numeric(-2),-0.01,length=100), 0, seq(
    r plot heatmap colorbar pheatmap 2017-06-06

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    哪個顏色鍵可以在小範圍值的熱圖中使用？

    我的數據涵蓋了一個小範圍，但我仍然希望在熱圖中顯示數據點之間的小差異。什麼顏色鍵最好最大化顏色強度（而不是生成灰色地圖）以及如何在pheatmap中設置範圍？
    range heatmap pheatmap color-key 2016-05-09

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    R：如何在pheatmap中設置p爲minkowski距離？

    在R中，有一個函數可以生成具有樹狀圖的熱圖，稱爲pheatmap::pheatmap。 minkowski是pheatmap繪製樹狀圖的距離測量選項之一。但是，如何設置功能pheatmap中的p（閔可夫斯基距離的功率）？ 謝謝。
    r distance pheatmap 2017-06-15

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    提取集羣的成員（pheatmap）

    我正在執行聚類分析並在R中使用pheatmap函數。我想提取集羣的每個成員。 ，我使用生成與k均值聚類pheatmap的命令是： pheatmap(t, kmeans_k=65, cluster_cols=F, mypalette3,display_numbers = T) 現在，我怎麼能得到每個簇的成員？ 數據： geneid S1 S2 S3 S4 M3 M4 M6 ENSRNOG000
    r cluster-analysis pheatmap 2017-03-08

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    特定值的Pheatmap顏色

    我對R很新，最近我一直在玩pheatmap庫來生成熱圖。我的問題是，我想以特定的方式爲我的熱圖着色。我將在下面說明： 值< 1應該是一個顏色漸變（例如深藍色淡藍色） 恰好等於1的值應爲深灰色 值> 1應該是一個顏色漸變（如暗紅色淺紅色） 我已經與breaks參數發揮各地和color參數與不同的調色板，但我似乎無法釘一個很好的解決方案。我來最接近的是這樣的： pheatmap(mtx, c
    r plot heatmap color-palette pheatmap 2017-01-21
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