爲MPICH配置的valgrind：錯誤libmpi * .so文件使用

當運行Valgrind的檢測MPI應用程序中的錯誤，我得到以下錯誤：爲MPICH配置的valgrind：錯誤libmpi * .so文件使用

libmpi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

我發現了以下工作： Valgrind documentation（第4.9節.1）指出：「MPI被包裝的函數被假定爲在與soname匹配的ELF共享對象libmpi.so *中，至少對Open MPI和Quadrics MPI來說這是正確的，並且可以很容易地被改變需要。」

因此，因爲我使用mpich2，它實際上應該使用libmpich.so.1.0。

這可以看出，在libmpiwrap.c：

#include "mpi.h" 

/* Where are API symbols? 
Open MPI  lib/libmpi.so, soname = libmpi.so.0 
Quadrics MPI lib/libmpi.so, soname = libmpi.so.0 
MPICH   libmpich.so.1.0, soname = libmpich.so.1.0 

A suitable soname to match with is therefore "libmpi*.so*".

我的問題是：在哪裏以及如何配置呢？

來源

2012-05-05 mort

你是如何配置/安裝Valgrind的？ MPICH2怎麼樣？IIRC它只是在你正確指定'--with-mpicc =/path/to/mpicc'到Valgrind的'configure'時起作用。還要確保您的MPICH2安裝配置了「--enable-shared」。 –

根據valgrind文檔，會自動檢測mpi安裝。我在哪裏可以看到哪些mpi安裝valgrind使用？配置只是告訴我，mpicc已被發現。 – mort

然後只要確保檢測到正確的MPI安裝。 '--with-mpicc ='選項只是幫助Valgrind找到正確的MPI安裝。 –

我自己有這個問題。希望這可以指出你在正確的方向。不幸的是，MPI很難與valgrind和gdb一起工作。

選項1：找到合適的包裝。

在Fedora/RHEL /（基於rpm的）系統上，您可以在valgrind-openmpi包中找到OpenMPI共享庫。我找不到MPICH版本。我使用MVAPICH，所以這並沒有幫助我。如果您找到MPICH/MVAPICH版本，請發表評論，以便我可以在此處添加它。

Valgrind OpenMPI

PBone示出了內容爲具有共享對象中的libmpiwrapper。

選項2：從源代碼構建庫。（我爲MVAPICH做了什麼）

我採取了從源代碼編譯valgrind，然後複製共享庫。我想保留valgrind的包管理器版本，所以我只匹配了源代碼的版本，並使用默認的GCC來保證安全。你可以使用最新，最好的，但我懷疑你得到了很多。

在構建Valgrind時，您需要確保它找到正確的MPI安裝。檢查輸出以驗證正確的共享庫和頭文件。我有一個在系統上安裝多個MPI的習慣，所以這是我學會了艱難的一步。花一些時間在autoconf/automake輸出上。幸運的是，Valgrind的維護人員在保持構建非常簡單方面做得很好，所以我沒有遇到任何編譯的主要問題。

源代碼 http://valgrind.org/downloads/

一旦你擁有了它，關鍵則因爲它們在文檔中提到建立ENV變量。

其他注意事項 - https://wiki.mpich.org/mpich/index.php/Support_for_Debugging_Memory_Allocation - https://fs.hlrs.de/projects/marmot/publications/paralleldebugging-ppt.pdf

來源

2015-10-18 17:37:54 msmith81886