matlab中的parse_inputs究竟做了什麼？

我正在閱讀matlab生物信息工具箱中的聚類函數。見cluster.m。matlab中的parse_inputs究竟做了什麼？

現在我用以下代碼的第五行填充。

function [clus, nclus, steps]=cluster(tr,v,varargin) 
numBranches=size(tr.tree,1); 
numLeaves=numBranches+1; 
numLabels=numBranches+numLeaves; 
[criteria, P, n]=parse_inputs(tr, numLeaves, varargin{:});

這是我的錯誤

我得到了varargin {：}是功能的可變參數的數量。

但是究竟發生了什麼？非常感謝您的時間和關注。

來源

2015-04-24 study

你在傳遞什麼參數？ 'varargin'表示之後有可選變量。 'varargin {：}'將所有這些變量輸入到'cluster'函數中。 – krisdestruction

我還應該注意''varargin'是一個包含這些參數的單元格 – krisdestruction

'parse_input'是一個[本地函數]（http://es.mathworks.com/help/matlab/matlab_prog/local-functions.html）。它在文件'cluster.m'的末尾定義。 –

這是一個本地功能。向下滾動以查看它。

每當你看到一個不熟悉的功能時，輸入which，然後輸入函數名稱來檢查它是否是Matlab函數;如果是，請輸入help以獲取有關如何使用它的更多信息，如果不是，那麼您需要在代碼中查找它。

此外，Matlab的內置函數在它們的命名（AFAIK）中不使用下劃線，所以您可能無法獲得MathWorks提供的功能。

從鏈接文件：

function [criteria,P,n] = parse_inputs(tr,numLeaves,varargin) 
% Parse the varargin parameter/value inputs 

% Check that we have the right number of PVP inputs 
if rem(numel(varargin),2)~= 0 
    error('Bioinfo:phytree:cluster:IncorrectNumberOfArguments',... 
     'Incorrect number of arguments to %s.',mfilename); 
end 

% The allowed inputs 
okargs = {'criterion','distances','maxclust'}; 

% Set default values 
P = squareform(pdist(tr)); % Pairwise distances, stored in square form 
          % since it will be indexed by row and columns 
n = inf; % default maximum number of clusters 
criteria = 'm'; % maximum is default criteria 

for j=1:2:numel(varargin)-1 
    [k, pval] = bioinfoprivate.pvpair(varargin{j}, varargin{j+1}, okargs, ['phytree:' mfilename]); 
    switch(k) 
     case 1 % 'criterion' 
      crits = {'maximum','average','median','silhouette','gain','ratio'}; 
      crit = strmatch(lower(pval),crits); 
      if isempty(crit) 
       error('Bioinfo:phytree:cluster:NotValidCriterion',... 
        'Not a valid criterion.') 
      elseif numel(crit)>1 
       error('Bioinfo:phytree:cluster:AmbiguousCriterion',... 
        'Ambiguous criterion.') 
      else 
       codes = 'madsgr'; 
       criteria = codes(crit); 
      end 
     case 2 % 'distances' 
      if isnumeric(pval) && isequal(size(pval),[numLeaves,numLeaves]) && all(~diag(pval)) && isequal(pval,pval') 
       P = pval; 
      elseif isnumeric(pval) && isvector(pval) && numel(pval)==(numLeaves*(numLeaves-1)/2) 
       P = squareform(pval); 
      else 
       error('Bioinfo:phytree:cluster:InvalidDistances',... 
         'DISTANCES must be compatible to the output of SEQPDIST, PDIST, or PHYTREE/PDIST.') 
      end 
     case 3 % 'maxclust' 
      if ~isnumeric(pval) || ~isscalar(pval) || rem(pval,1) || pval<1 
       error('Bioinfo:phytree:cluster:InvalidMaxClust',... 
         'MAXCLUST must be a positive integer.') 
      end 
      n = pval; 
    end 
end

來源

2015-04-24 23:14:48 Setsu

matlab中的parse_inputs究竟做了什麼？

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