如何從3D tiff圖像中提取零件？

Question

我有一個tiff文件，使用ImageJ在Z堆棧中排列多個灰度圖像，形成一個3D圖像。從這張圖片我想提取某些物體，即細胞體或軸突。

我不是在尋找自動分割，而是寧願手動選擇所需的區域。但是，我無法找到一款軟件，可以讓我在3D tiff圖像中繪製選區並導出選定的區域。

所以我的問題是，如果有這樣的軟件？

Answer 1

您可以使用3D套件爲可perfom自動分割及測量3D，請參見：

http://imagejdocu.tudor.lu/doku.php?id=plugin:stacks:3d_ij_suite:start

如果你有一個堆棧，你也可以手動標記，並填寫你的對象提取和用例如來衡量它們3D對象計數器。

另一種可能性是使用可訓練的分割插件標記堆棧中的類似區域，請參閱：

http://imagej.net/Trainable_Weka_Segmentation