如何在R語言中打印圖表的矩陣

從磁盤加載外部圖形作爲邊界列表後，我想要查看此圖形的矩陣格式。這是我的步驟：如何在R語言中打印圖表的矩陣

> rm(list=ls()) 
> data <- read.graph("c:\\temp\\graph.txt", format="edgelist") 
> adjm <- data.matrix(data) 
> adjm 
IGRAPH D--- 18 28 -- 
> 

> get.incidence(data) 
Error in get.incidence(data) : 
    Not a bipartite graph, supply `types' argument

矩陣不打印。外部圖形的數據格式是這樣（graph.txt）：

正如你所看到的，它只能打印圖形信息（節點的數量，直接或undirect）。我如何打印此圖爲關聯矩陣？或者我如何提供發射命令的類型？由於

來源

2014-03-26 shijie xu

嘗試'get.edgelist（data）'。 – jbaums

那麼如何處理get.edgelist結果呢？ –

對不起，我誤解了您的問題 - 請參閱下面的使用igraph的解決方案。 – jbaums

如果你有2列的矩陣M，那麼我們就可以創建0的方陣和

M <- M + 1 
adj <- matrix(0, max(M), max(M)) 
adj[M] <- 1

來源

2014-03-26 21:48:36

這一個也適用於鄰接矩陣後作出微小的變化adj [m] < - 1但是關於發生矩陣呢？ –

與連接節點的1填補它的igraph功能使這個非常簡單。

g <- graph.ring(10) 
g 

IGRAPH U--- 10 10 -- Ring graph 
+ attr: name (g/c), mutual (g/x), circular (g/x) 

get.adjacency(g) 

10 x 10 sparse Matrix of class "dgCMatrix" 

[1,] . 1 . . . . . . . 1 
[2,] 1 . 1 . . . . . . . 
[3,] . 1 . 1 . . . . . . 
[4,] . . 1 . 1 . . . . . 
[5,] . . . 1 . 1 . . . . 
[6,] . . . . 1 . 1 . . . 
[7,] . . . . . 1 . 1 . . 
[8,] . . . . . . 1 . 1 . 
[9,] . . . . . . . 1 . 1 
[10,] 1 . . . . . . . 1 .

裹get.adjacency在as.matrix如果你想它強制轉換爲二進制matrix。

來源

2014-03-26 22:48:47 jbaums

這個打印鄰接矩陣，但是關於發生矩陣呢？ –

道歉，我不知道正確的方法來克服你的'不是一個二分圖'錯誤。你需要正確地指定一個'type'參數（一個二進制向量和圖中頂點的數量相同），但是我不知道如何確定這個參數。隨意「不接受」這個答案，因爲它不能解決你的問題。 – jbaums

用法

get.incidence(your_graph, types = NULL, ......)

類型：一個可選的頂點類型的載體，而不是使用類型頂點屬性的。如果圖沒有類型的頂點屬性必須提供該參數

我們稱之爲數據幀爲「your_data_frame」和你的圖作爲「your_graph」

看起來你創建的類型爲未圖指定。它看起來像下面，其中類型被指定爲二分

> your_graph 
IGRAPH DN-- 65 333 -- 
+ attr: name (v/c) 
+ edges (vertex names):

的圖表看起來像在DN-B

> your_graph 
IGRAPH DN-B 92 22325 -- 
+ attr: name (v/c), type (v/l) 
+ edges (vertex names):

B代表二分

要指定的類型執行以下

V(your_graph)$type = V(your_graph)$name %in% your_data_frame[,1]

注意：your_data_frame應該只有兩列。如果執行這些步驟可以檢查your_graph後無法使用快速索引像DF [C（1,2）]

，現在類型應指定

，那麼你可以繼續創建使用

關聯矩陣

來源

2015-12-24 10:18:40 Jack

如何在R語言中打印圖表的矩陣

回答

相關問題