重新加載`filebacked.big.matrix`與R會話崩潰

感謝您閱讀本文！重新加載`filebacked.big.matrix`與R會話崩潰

在這裏，我有R.With使用big.matrix的問題，下面的代碼：

big_matrix_object=as.big.matrix(matrix_object,backingfile='back.bin',descriptorfile='back.desc,backingpath='./path/)

，如果我救big_matrix_object到時我重新加載它R對話會遇到.RData。而下一次如何避免這種情況？感謝您的幫助！

來源

2014-06-18 lovelyzlf

R中的big_matrix_object是指向存儲在磁盤上的備份文件的指針;每次重新啓動R會話後，都必須重新連接到文件，即使之前會話的.RDATA文件已加載。幸運的是一個簡單的辦法，重新啓動後的R和重裝bigmemory包，運行：

big_matrix_object <- attach.big.matrix("./path/back.desc")

當然這假設了big.matrix對象，並且其相關聯的備份文件，成功創建並保存在現有會話。

乾杯！

來源

2014-07-05 03:12:08

謝謝你的回答，@Jeff你的意思是我應該在每次開始R會話時附加矩陣。所以當我試圖將對象保存到.RDATA時，我應該以某種方式排除大.matrix對象，這似乎不是一個非常優雅的解決方案。你有任何其他方式來處理它嗎？我找到另一個包'bigmemoryExtra'，這似乎是原來的'bigmemroy'的增強，但每當我重新加載.RDATA雖然沒有會話崩潰，但big.matrix對象不再完整。 – lovelyzlf

http://cran.r-project.org/web/packages/bigmemory/bigmemory.pdf –

不客氣，樂意效勞。一個big.matrix由R中的一個對象組成，它只是指向數據結構，在你的情況下，它存儲在磁盤上。這是文件支持大矩陣的全部重點;它允許您創建和操作太大的數據結構以存儲在內存中（因此實際上並未加載到R工作區中）。保存工作區/數據時，不需要排除任何內容。我強烈建議您閱讀本文檔，解釋bigmemory如何管理數據（特別是第6頁）：[BM]（http://cran.r-project.org/web/packages/bigmemory/bigmemory.pdf） –

重新加載`filebacked.big.matrix`與R會話崩潰

回答

相關問題