我有ggplot中的幾列數據我希望繪製在boxplot中。每個方框代表一列數據。這些箱子應該以四個一組(紅,綠,藍,黃)着色,即每2盒被染成綠色每四個被標記爲黃色等ggplot中的着色boxplot列以重複模式
樣本數據
X1 X1.1 X1.2 X1.3 X2 X2.1 X2.2 X2.3
1 2 3 4 3 2 3 1
2 4 5 5 5 2 1 2
2 3 2 1 2 1 2 5
我得到的最接近使用重複的顏色值填充矢量colorVec並嘗試將其應用於ggplot。
graph<-ggplot(expressionframemelted, aes(x = Var2, y=value)) +
geom_boxplot(aes(fill = factor(Var2)))+
ggtitle("Expression Values and Medians")+xlab(valueAmountsP)+ylab("Counts log 10")+
stat_summary(fun.y = median, geom = "point", position = position_dodge(width = .9),
size = 6, shape = 4, show_guide = F)+
theme(axis.text.x=element_text(angle=90))+
scale_x_discrete(labels=nameVecGraph)+
scale_y_log10()+
scale_fill_manual(values = colorVec)
的問題是,如果列值是非常低或零到一箱未對劇情ggplot由於某種原因出現使用填充他們跳過,並繼續到下一個塔的點擰緊着色的順序。
任何更簡單的方法呢?
編輯:我試過epi的答案,但ggplot跳過低值的列和混亂的顏色順序的問題依然存在。我發現這可能是由於使用了對數刻度。例如嘗試
ggplot(dfmelt, aes(variable, value, fill=variable)) +
geom_boxplot() +
theme(axis.text.x=element_text(angle=90))+
scale_x_discrete(labels=c('C1','C2','C3','C4','C5','C6','C7','C8'))+
scale_y_log10()+
scale_fill_manual(values=rep(c("red","green","blue","yellow"),2))
上
df = read.table(text="X1 X1.1 X1.2 X1.3 X2 X2.1 X2.2 X2.3
1 0 3 4 3 2 3 1
2 'NA' 5 5 5 2 1 2
2 'NA' 2 1 2 1 2 5", header=TRUE)
喜的是%>%? Rstudio咳嗽它,我試圖在谷歌上查找它,但我找不到它。 –
我的不好;我忘了在我的代碼中包含'dplyr'軟件包。我現在修好了。 '%>%'是一個允許你將功能鏈接在一起的運算符。參見['dplyr' vignette](https://cran.rstudio.com/web/packages/dplyr/vignettes/introduction.html)。如果您想避免在ggplot調用中執行此操作,可以將數據融化爲ggplot外的長格式。只要執行'df.melt = melt(df)',然後在ggplot中使用'df.melt'而不是'df'。 – eipi10
嗨,問題是如果我使用日誌10規模ggplot將出於某種原因跳過低價值列擰緊顏色的順序。看看編輯 –