如何繪製離散類別的頻率？

Question

您好我有一個數據幀，看起來像這樣：

Seq  H E T C 
1 Seq_1 2 1 5 4 
2 Seq_2 2 1 5 4 
3 Seq_3 2 1 5 4 
4 Seq_4 0 0 6 6 
5 Seq_5 0 4 2 6  

其中，H，E，T和C分別代表的每個序列內的這些特徵的計數。

我試圖建立一個線圖，其中每一行應該代表一個序列。 X軸是特徵（H，E，T，C），Y軸是其相應的計數，所以這些線將顯示每個序列內計數的變化。

我該怎麼做？我已經搞砸了很多東西，但無法做到！

Answer 1

ggplot的訣竅是它期望數據是「長」格式。用melt這種格式來獲取它通常是最容易的。一旦融化，它就成爲您想要查看它的指定劇情的練習。這裏有一個例子：

txt <- " Seq  H E T C 
1 Seq_1 2 1 5 4 
2 Seq_2 2 1 5 4 
3 Seq_3 2 1 5 4 
4 Seq_4 0 0 6 6 
5 Seq_5 0 4 2 6 " 

dat <- read.table(textConnection(txt), header = TRUE) 
library(ggplot2) 

dat.m <- melt(dat) 


ggplot(dat.m, aes(variable, value, group = Seq, colour = Seq)) + 
    geom_line() 

這導致Seq_1一些overplotting問題 - Seq_3所以你可能要考慮刪除的顏色和小面來代替：當你有數百

ggplot(dat.m, aes(variable, value, group = Seq)) + 
    geom_line() + 
    facet_wrap(~Seq) 

刻面明顯變得不那麼有用序列來審查。