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R/ggplot2 - 按天排序，按錯誤順序排列

2016-11-19 103 views
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我正在嘗試繪製一些時間序列數據，並在一天之內對其進行打分。我在管理方面沒有問題，但無法理解爲什麼每天的x軸不按正確的順序排列。也就是說，不是從0:00開始到23:59結束，而是從22:00開始到22:00結束。任何幫助，不勝感激：R/ggplot2 - 按天排序，按錯誤順序排列

enter image description here

#Convert Datetime column to R POSIXct 
original_data$Date<-as.POSIXct(x = original_data$Date, format = "%m/%d/%Y %H:%M") 

#Set reference values to numeric 
original_data$Reference<-as.numeric(original_data$Reference) 

calibration_plot<-ggplot(original_data, aes(Date, Reference)) + 
facet_wrap(~DOY, scales = "free") + xlab("Time (hours)") + 
geom_point()+  ylab(expression(Radiation ~ (W ~ m^{-2}))) + 
scale_x_datetime(labels = date_format("%H")) + ggtitle("Calibration 
Plots") + theme_bw() + theme(axis.text=element_text(size=12), 
axis.title=element_text(size=12,face="bold"), title = 
element_text(size=10, face = "bold")) 


Date DOY Reference 
11/7/2016 0:01 312 -0.0137 
11/7/2016 0:06 312 -0.01525 
11/7/2016 0:11 312 -0.01325 
11/7/2016 0:16 312 -0.
11/7/2016 0:21 312 -0.0119 
11/7/2016 0:26 312 -0.0112 
11/7/2016 0:31 312 -0.0109 
11/7/2016 0:36 312 -0.0112 
11/7/2016 0:41 312 -0.0105 
11/7/2016 0:46 312 -0.00865 
11/7/2016 0:51 312 -0.00875 
11/7/2016 0:56 312 -0.0081 
11/7/2016 1:01 312 -0.00885 
11/7/2016 1:06 312 -0.00775 
11/7/2016 1:11 312 -0.0086 
11/7/2016 1:16 312 -0.0085 
11/7/2016 1:21 312 -0.00915 
11/7/2016 1:26 312 -0.0077 
11/7/2016 1:31 312 -0.0114 
11/7/2016 1:36 312 -0.0148 
11/7/2016 1:41 312 -0.0121 
11/7/2016 1:46 312 -0.012 
11/7/2016 1:51 312 -0.0121 
11/7/2016 1:56 312 -0.0086 
11/7/2016 2:01 312 -0.00915 
11/7/2016 2:06 312 -0.00945 
11/7/2016 2:11 312 -0.0072 
11/7/2016 2:16 312 -0.00485 
11/7/2016 2:21 312 -0.006 
11/7/2016 2:26 312 -0.00605 
11/7/2016 2:31 312 -0.00685 
11/7/2016 2:36 312 -0.00905 
11/7/2016 2:41 312 -0.01085 
11/7/2016 2:46 312 -0.0133 
11/7/2016 2:51 312 -0.0118 
11/7/2016 2:56 312 -0.01285 
11/7/2016 3:01 312 -0.0125 
11/7/2016 3:06 312 -0.0108 
11/7/2016 3:11 312 -0.0114 
11/7/2016 3:16 312 -0.01165 
11/7/2016 3:21 312 -0.0117 
11/7/2016 3:26 312 -0.0116 
11/7/2016 3:31 312 -0.01155 
11/7/2016 3:36 312 -0.01345 
11/7/2016 3:41 312 -0.01375 
11/7/2016 3:46 312 -0.01405 
11/7/2016 3:51 312 -0.01195 
11/7/2016 3:56 312 -0.012 
11/7/2016 4:01 312 -0.0115 
11/7/2016 4:06 312 -0.01215 
11/7/2016 4:11 312 -0.01155 
11/7/2016 4:16 312 -0.013 
11/7/2016 4:21 312 -0.01135 
11/7/2016 4:26 312 -0.01165 
11/7/2016 4:31 312 -0.01125 
11/7/2016 4:36 312 -0.01025 
11/7/2016 4:41 312 -0.0106 
11/7/2016 4:46 312 -0.0118 
11/7/2016 4:51 312 -0.01045 
11/7/2016 4:56 312 -0.0108 
11/7/2016 5:01 312 -0.01315 
11/7/2016 5:06 312 -0.01155 
11/7/2016 5:11 312 -0.01195 
11/7/2016 5:16 312 -0.01255 
11/7/2016 5:21 312 -0.01145 
11/7/2016 5:26 312 -0.011 
11/7/2016 5:31 312 -0.0108 
11/7/2016 5:36 312 -0.01115 
11/7/2016 5:41 312 -0.0104 
11/7/2016 5:46 312 -0.00325 
11/7/2016 5:51 312 0.01585 
11/7/2016 5:56 312 0.0383 
11/7/2016 6:01 312 0.0541 
11/7/2016 6:06 312 0.08845 
11/7/2016 6:11 312 0.16495 
11/7/2016 6:16 312 0.2525 
11/7/2016 6:21 312 0.3453 
11/7/2016 6:26 312 0.4411 
11/7/2016 6:31 312 0.5581 
11/7/2016 6:36 312 0.73945 
11/7/2016 6:41 312 0.84045 
11/7/2016 6:46 312 1.0619 
11/7/2016 6:51 312 1.50535 
11/7/2016 6:56 312 1.7774 
11/7/2016 7:01 312 1.9699 
11/7/2016 7:06 312 1.94915 
11/7/2016 7:11 312 1.984 
11/7/2016 7:16 312 2.17855 
11/7/2016 7:21 312 2.5005 
11/7/2016 7:26 312 2.35345 
11/7/2016 7:31 312 2.43305 
11/7/2016 7:36 312 2.63425 
11/7/2016 7:41 312 3.16065 
11/7/2016 7:46 312 3.34475 
11/7/2016 7:51 312 3.2605 
11/7/2016 7:56 312 3.3372 
11/7/2016 8:01 312 3.3398 
11/7/2016 8:06 312 3.43235 
11/7/2016 8:11 312 3.8922 
11/7/2016 8:16 312 4.359 
11/7/2016 8:21 312 4.4112 
11/7/2016 8:26 312 4.7168 
11/7/2016 8:31 312 4.8878 
11/7/2016 8:36 312 5.05045 
11/7/2016 8:41 312 5.20745 
11/7/2016 8:46 312 4.82285 
11/7/2016 8:51 312 5.19705 
11/7/2016 8:56 312 4.9623 
11/7/2016 9:01 312 5.164 
11/7/2016 9:06 312 5.85755 
11/7/2016 9:11 312 5.91635 
11/7/2016 9:16 312 6.20635 
11/7/2016 9:21 312 6.3367 
11/7/2016 9:26 312 6.4511 
11/7/2016 9:31 312 6.5009 
11/7/2016 9:36 312 6.55115 
11/7/2016 9:41 312 6.77255 
11/7/2016 9:46 312 6.73385 
11/7/2016 9:51 312 6.739 
11/7/2016 9:56 312 7.0979 
11/7/2016 10:01 312 7.2608 
11/7/2016 10:06 312 7.39525 
11/7/2016 10:11 312 7.32865 
11/7/2016 10:16 312 7.4016 
11/7/2016 10:21 312 7.70725 
11/7/2016 10:26 312 7.8645 
11/7/2016 10:31 312 7.8682 
11/7/2016 10:36 312 8.0161 
11/7/2016 10:41 312 7.7934 
11/7/2016 10:46 312 5.99495 
11/7/2016 10:51 312 8.25685 
11/7/2016 10:56 312 8.7265 
11/7/2016 11:01 312 8.5505 
11/7/2016 11:06 312 8.1372 
11/7/2016 11:11 312 5.0642 
11/7/2016 11:16 312 5.0355 
11/7/2016 11:21 312 6.32535 
11/7/2016 11:26 312 5.8676 
11/7/2016 11:31 312 7.37175 
11/7/2016 11:36 312 6.1949 
11/7/2016 11:41 312 5.01225 
11/7/2016 11:46 312 5.91725 
11/7/2016 11:51 312 6.7572 
11/7/2016 11:56 312 7.70375 
11/7/2016 12:01 312 8.12815 
11/7/2016 12:06 312 6.04805 
11/7/2016 12:11 312 5.2638 
11/7/2016 12:16 312 4.85 
11/7/2016 12:21 312 4.2291 
11/7/2016 12:26 312 4.2851 
11/7/2016 12:31 312 4.99735 
11/7/2016 12:36 312 4.7308 
11/7/2016 12:41 312 5.2383 
11/7/2016 12:46 312 6.9894 
11/7/2016 12:51 312 6.8357 
11/7/2016 12:56 312 9.124 
11/7/2016 13:01 312 9.2875 
11/7/2016 13:06 312 7.11615 
11/7/2016 13:11 312 7.8034 
11/7/2016 13:16 312 5.29235 
11/7/2016 13:21 312 6.02785 
11/7/2016 13:26 312 5.6154 
11/7/2016 13:31 312 3.5963 
11/7/2016 13:36 312 2.88325 
11/7/2016 13:41 312 2.7976 
11/7/2016 13:46 312 3.07845 
11/7/2016 13:51 312 3.55455 
11/7/2016 13:56 312 3.2716 
11/7/2016 14:01 312 2.8856 
11/7/2016 14:06 312 4.42685 
11/7/2016 14:11 312 6.93045 
11/7/2016 14:16 312 6.68565 
11/7/2016 14:21 312 6.0181 
11/7/2016 14:26 312 3.3964 
11/7/2016 14:31 312 3.3697 
11/7/2016 14:36 312 2.99275 
11/7/2016 14:41 312 5.2926 
11/7/2016 14:46 312 4.70665 
11/7/2016 14:51 312 4.16065 
11/7/2016 14:56 312 3.7451 
11/7/2016 15:01 312 3.47665 
11/7/2016 15:06 312 3.2893 
11/7/2016 15:11 312 3.0863 
11/7/2016 15:16 312 2.9122 
11/7/2016 15:21 312 2.71525 
11/7/2016 15:26 312 2.50645 
11/7/2016 15:31 312 2.26005 
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11/7/2016 15:41 312 1.89285 
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11/7/2016 15:56 312 1.4291 
11/7/2016 16:01 312 1.1776 
11/7/2016 16:06 312 1.03155 
11/7/2016 16:11 312 0.8916 
11/7/2016 16:16 312 0.73225 
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11/7/2016 16:31 312 0.35235 
11/7/2016 16:36 312 0.2142 
11/7/2016 16:41 312 0.11565 
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11/7/2016 18:11 312 -0.0213 
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11/9/2016 18:41 314 -0.01875 
11/9/2016 18:46 314 -0.0196 
11/9/2016 18:51 314 -0.
11/9/2016 18:56 314 -0.01185 
11/9/2016 19:01 314 -0.01485 
11/9/2016 19:06 314 -0.0187 
11/9/2016 19:11 314 -0.02015 
11/9/2016 19:16 314 -0.01935 
11/9/2016 19:21 314 -0.0197 
11/9/2016 19:26 314 -0.01885 
11/9/2016 19:31 314 -0.0218 
11/9/2016 19:36 314 -0.0169 
11/9/2016 19:41 314 -0.01205 
11/9/2016 19:46 314 -0.01245 
11/9/2016 19:51 314 -0.0112 
11/9/2016 19:56 314 -0.01655 
11/9/2016 20:01 314 -0.0185 
11/9/2016 20:06 314 -0.0204 
11/9/2016 20:11 314 -0.0227 
11/9/2016 20:16 314 -0.02115 
11/9/2016 20:21 314 -0.01345 
11/9/2016 20:26 314 -0.0135 
11/9/2016 20:31 314 -0.0191 
11/9/2016 20:36 314 -0.0172 
11/9/2016 20:41 314 -0.0136 
11/9/2016 20:46 314 -0.0129 
11/9/2016 20:51 314 -0.0176 
11/9/2016 20:56 314 -0.01285 
11/9/2016 21:01 314 -0.0138 
11/9/2016 21:06 314 -0.0179 
11/9/2016 21:11 314 -0.0193 
11/9/2016 21:16 314 -0.02365 
11/9/2016 21:21 314 -0.02045 
11/9/2016 21:26 314 -0.0218 
11/9/2016 21:31 314 -0.0215 
11/9/2016 21:36 314 -0.02105 
11/9/2016 21:41 314 -0.0184 
11/9/2016 21:46 314 -0.01795 
11/9/2016 21:51 314 -0.01945 
11/9/2016 21:56 314 -0.01865 
11/9/2016 22:01 314 -0.01425 
11/9/2016 22:06 314 -0.0125 
11/9/2016 22:11 314 -0.0093 
11/9/2016 22:16 314 -0.01355 
11/9/2016 22:21 314 -0.
11/9/2016 22:26 314 -0.01205 
11/9/2016 22:31 314 -0.01225 
11/9/2016 22:36 314 -0.0138 
11/9/2016 22:41 314 -0.01255 
11/9/2016 22:46 314 -0.01655 
11/9/2016 22:51 314 -0.01695 
11/9/2016 22:56 314 -0.01605 
11/9/2016 23:01 314 -0.018 
11/9/2016 23:06 314 -0.01165 
11/9/2016 23:11 314 -0.00995 
11/9/2016 23:16 314 -0.0181 
11/9/2016 23:21 314 -0.0137 
11/9/2016 23:26 314 -0.014 
11/9/2016 23:31 314 -0.02185 
11/9/2016 23:36 314 -0.0238 
11/9/2016 23:41 314 -0.02165 
11/9/2016 23:46 314 -0.02095 
11/9/2016 23:51 314 -0.01925 
11/9/2016 23:56 314 -0.0201

來源

2016-11-19 Isaac

+0

請使這種可重複性，否則它將是非常困難的人來幫助你。 – Axeman

+0

我在前幾天添加了數據。還有什麼會有用的嗎？這是我第一次在這裏發帖，所以任何指針都是值得歡迎的。 – Isaac

+1

粘貼在'dput（）'的輸出中發佈你的數據。這樣，我們將擁有一個與您的實際數據框完全相同結構的數據框。例如，要發佈數據的前40行，請粘貼'dput（original_data [1:40，]）'的輸出。 – eipi10

回答

2

TL; DR：這看起來像一個時區的問題。將日期轉換爲POSIXct時，默認時區是您的本地時區。但是，當您在ggplot內運行date_format()時，日期在繪圖之前會轉換爲GMT，所以時間將全部移位GMT與當地時區之間的差異。要獲得正確的小時繪圖，您可以在date_format之內明確設置所需的時區，或者在將Date轉換爲POSIXct時，您可以明確地將時區設置爲GMT。

在編寫ggplot代碼之前，讓我們來看看您的數據。下面，我已經開始與您的數據Date到POSIXct轉換前：

head(original_data) 
str(original_data) 

  Date DOY Reference 
1 11/7/2016 0:01 312 -0.01370 
2 11/7/2016 0:06 312 -0.01525 
3 11/7/2016 0:11 312 -0.01325 
4 11/7/2016 0:16 312 -0.
5 11/7/2016 0:21 312 -0.01190 
6 11/7/2016 0:26 312 -0.01120 

'data.frame': 864 obs. of 3 variables: 
$ Date  : chr "11/7/2016 0:01" "11/7/2016 0:06" "11/7/2016 0:11" "11/7/2016 0:16" ... 
$ DOY  : int 312 312 312 312 312 312 312 312 312 312 ... 
$ Reference: num -0.0137 -0.0152 -0.0132 -0.-0.0119 ...

現在讓我們轉換Date到POSIXct兩種不同的方式：首先，如果沒有設置時區，然後將時區設置爲GMT。需要注意的是Date1是在我的本地時區（美國太平洋），而Date2爲GMT，雖然字面時間字符串是相同的：

original_data$Date1 <- as.POSIXct(x = original_data$Date, format = "%m/%d/%Y %H:%M") 
original_data$Date2 <- as.POSIXct(x = original_data$Date, format = "%m/%d/%Y %H:%M", tz="GMT") 

head(original_data$Date1) 

[1] "2016-11-07 00:01:00 PST" "2016-11-07 00:06:00 PST" "2016-11-07 00:11:00 PST" "2016-11-07 00:16:00 PST" 
[5] "2016-11-07 00:21:00 PST" "2016-11-07 00:26:00 PST" 

head(original_data$Date2) 

[1] "2016-11-07 00:01:00 GMT" "2016-11-07 00:06:00 GMT" "2016-11-07 00:11:00 GMT" "2016-11-07 00:16:00 GMT" 
[5] "2016-11-07 00:21:00 GMT" "2016-11-07 00:26:00 GMT"

以下是date_format函數的代碼。請注意，默認tz（時區）設置爲UTC，與GMT相同。所以date_format正轉向從你的數據的時區時間值GMT：

date_format 

function (format = "%Y-%m-%d", tz = "UTC") 
{ 
    function(x) format(x, format, tz = tz) 
}

現在對於ggplot：首先，我們將與Date1工作。在下面的例子中，請注意，當我們使用默認日期格式時，小時數是正確的。然而，當我們使用scale_x_datetime而沒有指定時區時，它看起來像ggplot正在從我當地的時區（美國太平洋）轉移到8小時後的GMT。但是，當我在date_format()中指定「America/Los_Angeles」時區時，我會得到所需的小時值。

# Create plot with Date1, but without scale_x_datetime 
p = ggplot(original_data, aes(Date1, Reference)) + 
    facet_wrap(~ DOY, scales="free_x") + 
    xlab("Time (hours)") + 
    geom_point() +  
    ylab(expression(Radiation ~ (W ~ m^{-2}))) + 
    ggtitle("Calibration Plots") + 
    theme_bw() + 
    theme(axis.title=element_text(size=12,face="bold"), 
     title = element_text(size=9, face = "bold")) 

p + scale_x_datetime(date_breaks = "3 hours") + 
    ggtitle("Default date formatting") + 
    theme(axis.text.x=element_text(size=9, angle=-90, , vjust=0.5)) 
p + scale_x_datetime(date_breaks = "3 hours", labels=date_format("%H")) + 
    ggtitle('date_format("%H")') 
p + scale_x_datetime(date_breaks = "3 hours", labels=date_format("%H", tz="America/Los_Angeles")) + 
    ggtitle('date_format("%H", tz="America/Los_Angeles")')

enter image description here

在另一方面，如果我們使用Date2，它已經被設置爲GMT時區，那麼我們就不需要內date_format()指定時區：

# Create plot with Date2, but without scale_x_datetime 
p = ggplot(original_data, aes(Date2, Reference)) + 
    facet_wrap(~ DOY, scales="free_x") + 
    xlab("Time (hours)") + 
    geom_point() +  
    ylab(expression(Radiation ~ (W ~ m^{-2}))) + 
    ggtitle("Calibration Plots") + 
    theme_bw() + 
    theme(axis.title=element_text(size=12,face="bold"), 
     title = element_text(size=9, face = "bold")) 

p + scale_x_datetime(date_breaks = "3 hours") + 
    ggtitle("Default date formatting") + 
    theme(axis.text.x=element_text(size=9, angle=-90, , vjust=0.5)) 
p + scale_x_datetime(date_breaks = "3 hours", labels=date_format("%H")) + 
    ggtitle('date_format("%H")') 
p + scale_x_datetime(date_breaks = "3 hours", labels=date_format("%H", tz="GMT")) + 
    ggtitle('date_format("%H", tz="GMT")')

enter image description here

來源

2016-11-19 18:27:47 eipi10

+0

非常全面的答案。另請注意，「scale _ * _ datetime（）'現在支持時區，它將默認使用附加到變量的時區，但可以使用'timezone'參數覆蓋。 （來自NEWS。） – Axeman

+0

謝謝！這是非常清晰和徹底。我真的很感激你花時間來引導我爲什麼會發生這種情況以及修復它的選項。 – Isaac

+1

@Axeman，謝謝你讓我知道，因爲我沒有意識到這一點（我猜我沒有跟上最新的ggplot2新聞，我也應該）。艾薩克，不客氣！ – eipi10

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