如何改進RDF文檔？

上午建立了一個化學品目錄。下面的例子是2,4-D（農藥）。如何改進RDF文檔？

長期目標是將許多RDF文件合併到具有推理能力的OWL「目錄」中。

短期目標是一次構建一個RDF文件。

然後，當RDF文件合併到OWL目錄中時，將添加新的關係和推理規則。下面

我的短期做法是：

申報本體。
使用SKOS設置概念。
使用DBpedia設置廣義術語。
使用DBpedia來設置確切的術語。
確定確切的和類似的項目。
定義資源圖和聚合。
分項集合。

這裏是RDF：

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> 
<rdf:RDF 
    xmlns:dcterms="http://purl.org/dc/terms/" 
    xmlns:agrontology="http://aims.fao.org/aos/agrontology#" 
    xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" 
    xmlns:cheminf="http://semantiscience.org/resource/" 
    xmlns:dbp="http://dbpedia.org/resource/" 
    xmlns:ore="http://www.openarchives.org/ore/terms/" 
    xmlns:skos="http://www.w3.org/2004/02/skos/core#" 
    xmlns:schema="http://schema.org/"> 
    <skos:Concept rdf:about="http://dbpedia.org/resource/Chemical_substance"> 
    <ore:aggregatedBy rdf:resource="http://dbpedia.org/resource/Chemical_substance#Aggregation" /> 
    </skos:Concept> 
    <ore:aggregates rdf:about="http://dbpedia.org/resource/Chemical_substance"> 
    <cheminf:CHEMINF_000266>chemical substance</cheminf:CHEMINF_000266> 
    </ore:aggregates> 
    <ore:ResourceMap rdf:about="http://dbpedia.org/resource/Chemical_substance#ResourceMap"> 
    <ore:describes rdf:resource="http://dbpedia.org/resource/Chemical_substance#Aggregation" /> 
    </ore:ResourceMap> 
    <dbp:Chemical rdf:about="http://dbpedia.org/resource/2,4-Dichlorophenoxyacetic_acid"> 
    <schema:name>2,4-Dichlorophenoxyacetic acid</schema:name> 
    </dbp:Chemical> 
    <cheminf:CHEMINF_000140 rdf:about="http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/rdf/compound/CID1486"> 
    <schema:name>PubChem CID:1486</schema:name> 
    <rdf:type rdf:resource="http://dbpedia.org/resource/Chemical"/> 
    </cheminf:CHEMINF_000140> 
    <dbp:Chemical rdf:about="http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh85037669"> 
    <schema:name>LCSH:85037669</schema:name> 
    <skos:closeMatch> 
     <cheminf:CHEMINF_000140 rdf:about="http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/rdf/compound/CID1486"> 
     <schema:name>PubChem CID:1486</schema:name> 
     <rdf:type rdf:resource="http://dbpedia.org/resource/Chemical"/> 
     </cheminf:CHEMINF_000140> 
    </skos:closeMatch> 
    </dbp:Chemical> 
    <dbp:Chemical rdf:about="http://lod.nal.usda.gov/nalt/1353"> 
    <schema:name>NALT:1353</schema:name> 
    <schema:sameAs rdf:resource="http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/rdf/compound/CID1486"/> 
    </dbp:Chemical> 
    <dbp:Chemical rdf:about="http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_8543"> 
    <schema:name>Agrovoc:8543</schema:name> 
    <schema:sameAs rdf:resource="http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/rdf/compound/CID1486"/> 
    <rdf:type rdf:resource="http://aims.fao.org/aos/agrontology#hasCodeAgrovoc"/> 
    </dbp:Chemical> 
    <ore:Aggregation rdf:about="http://dbpedia.org/resource/Chemical_substance#Aggregation"> 
    <ore:describedBy rdf:resource="http://dbpedia.org/resource/Chemical_substance#ResourceMap" /> 
    <ore:aggregates rdf:resource="http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/rdf/compound/CID1486" /> 
    <ore:aggregates rdf:resource="http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_8543" /> 
    <ore:aggregates rdf:resource="http://dbpedia.org/resource/2,4-Dichlorophenoxyacetic_acid" /> 
    <ore:aggregates rdf:resource="http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh85037669" /> 
    <ore:aggregates rdf:resource="http://lod.nal.usda.gov/nalt/1353" /> 
    </ore:Aggregation> 
</rdf:RDF>

我怎麼能在這種方法改善？例如：

添加更多表達關係。
使其更加緊湊。
爲本體建立起源（使用http://www.w3.org/TR/prov-o/）;一個權限;一個物品？
更好地組織與其他RDF文件組合到一個OWL環境的文件？

謝謝你在這裏的幫助。

來源

2014-02-06 Jay Gray

你有什麼理由要結合RDF和OWL嗎？ OWL的RDF序列化並不特別好。此外，SKOS有點像「窮人的貓頭鷹」，你如何以及爲什麼要將它們結合起來？什麼是您創建的最終結果的用例？你真的需要出處嗎？究竟是什麼？爲什麼？ –

思想是從小規模（RDF斷言）開始，然後在OWL DL環境中聚合它們以表達項目之間更復雜的關係。當然，如果這樣會導致問題出現，那麼肯定可以使用替代本體（例如SKOS的替代品）。示例用例爲：「區域」中的「規定」所設置的「限制」（數值範圍）內的「植物」（特定物種）「hasPest」（特定物種），其中Plant「is ProtectedBy」「Chemical」。 –

這聽起來很合理，但對我來說，似乎在某些時候，您將不得不將數據從RDF/S遷移到OWL，這樣可以嗎？您提供的示例將被我簡單的RDF/S覆蓋。無論如何，我更想知道如何在現實世界中使用結果？你想解決什麼問題？你有什麼工具？你需要某種推理嗎？它是否以統一格式交換數據的目的完成？ –

我相信問題＃2和＃4可以通過考慮從您的表示中刪除架構樣式元素的想法來解決。您提供的數據似乎將域概念的定義（即：ChemicalSubstance是Concept）與實例信息（http://dbpedia.org/resource/2,4-Dichlorophenoxyacetic_acid http://schema.org/name "2,4-Dichlorophenoxyacetic acid"）混合在一起。這裏的一個最佳實踐是保留單個詞彙/本體來描述將用於表示單個化學品實例數據的主幹結構。

我還想在表面層面注意，看起來你可能不會一直使用rdf:type來定義班級成員資格。此外，您可能正在使用rdf:type，而您可能更願意使用rdfs:subClassOf。

我建議將這些不同的文檔存儲在RDF dataset的命名圖中。使用一些一致的約定爲每個化學圖創建一個有意義的IRI。

＃3（來源信息）最簡單的方法可能是存儲描述與每個文檔（名爲圖）存儲在一起的owl:Ontology（x在these examples）的三元組。這遵循現有的慣例，但如果組合了命名圖（因爲每個圖的三元組不一定需要註釋以描述包含它們的本體）。根據偏好，一個小的變化就是將出處信息存儲在數據存儲的默認圖表中，以便將化學元信息與描述分開。

來源

2014-04-09 13:01:31

如何改進RDF文檔？

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