拼合alpha通道中GGPLOT2

Question

GGPLOT2的某些對象（功能）支持alpha通道。

http://docs.ggplot2.org/current/geom_point.html

這是一個不錯的功能，但透明色PDF和PNG文件往往是多元化的煩惱之源。

我如何可以使用Alpha選項，並得到平坦的PDF輸出文件？

Answer 1

爲了避免與膠乳圖形相似的麻煩，我生成R. PNG文件在那裏，你可以用type = c("cairo", "cairo-png", ...)選項打球，對我來說，「窗口」也能正常工作。之後，我用imagemagick將它轉換爲jpg，並將此jpg包含在我的LaTeX文件中，然後將pdfLaTeX結果包含在平整的pdf輸出中。

Answer 2

我曾與knitr + ggplot創造了大量乳膠文檔，這是我的Mac上完全可讀但不能打開Windows用戶持續存在的問題。經過多次嘗試優化和壓縮pdf後，我終於將問題孤立在一個單一的阿爾法重陰謀。在我的情況下，從pdf切換到PNG輸出有所不同（儘管根據你的問題，這聽起來像PNG可能無法解決你的問題）。

如果您使用的是knitr，您可以通過將全局（或特定於塊的）圖像輸出選項dev設置爲「png」而不是默認的「pdf」來自動創建png版本。取決於情節，這可以顯着縮小α重ggplot的複雜度。我的繪圖文件大小從〜700KB減少到〜70KB（一些簡單的繪圖實際上可能會增加）。

權衡是有可能成爲該地塊分辨率的一些損失。爲了通過電子郵件或特定類型的情節傳播草稿，這可能沒有問題。如果分辨率損失太大，請考慮調整輸出的dpi（儘管這當然會增加文件大小，但在跨平臺設置中仍可能會更好）。

設置全局圖像輸出到「PNG」你可以使用這樣的代碼：

library(knitr) 
    opts_chunk$set(dev="png", dpi=200) 

要設置輸出爲「PNG」一個塊特定的範圍內（例如，只是情節是爲α-重），請使用dev="png"選項。下面的例子會生成一個規則的，非alpha重的圖。使用knitr + Latex時，include=FALSE選項將防止自動包含pdf版本（我不確定這是否需要RMarkdown）。

<<myplot, dev="png", dpi=200, include=FALSE>> 
    library(ggplot2) 
    x <- 1:1000 
    y <- 2*x + rnorm(1000, 0, 100) 
    df <- data.frame(x,y) 
    ggplot(df, aes(x=x, y=y)) + geom_point(alpha=.3) 
    @ 

上面的代碼將產生，在乳膠，然後可以很容易地包括在文檔中與includegraphics命令嵌套在圖環境中的文件名爲myplot.png。

\begin{figure}[h!] 
    \centering 
    \scalebox{.5}{\includegraphics{myplot.png}} 
    \caption{Some caption \label{fig:myplot}} 
    \end{figure} 

可能有幫助的另一個資源是在r博客託管這篇博客文章：

Fast-track publishing using knitr: exporting images for sharing and press

而且，看到的knitr options的圖形部分。