Biopython密碼錶錯誤？

Question

我正在編寫一些代碼，旨在將含糊的DNA代碼翻譯爲可能的氨基酸，我從Biopython 1.56軟件包中看到了一些奇怪的翻譯。它似乎是將不明確的DNA代碼翻譯成'J'，它不作爲任何代碼存在。我在Mac OS 10.6.6上運行python 2.6.1。

例如：

>>>from Bio.Seq import * 
>>>translate('ARAWTAGKAMTA') 
'XJXJ' 

或

>>>from Bio.Seq import Seq 
>>>c = Seq('ARAWTAGKAMTA') 
>>>c.translate().tostring() 
'XJXJ' 

我已經通過Bio.Data.CodonTable源和Bio.Seq來源看，我無法找到一個理由，爲什麼這會發生。有任何想法嗎？

謝謝！

馬克

Answer 1

J是亮氨酸（L）或異亮氨酸（I），在的質譜（NMR）使用。

參見http://biostar.stackexchange.com/questions/5688/biopython-translation-error