顯示R中的差異分析樹（使用graphviz）

我在做R中的差異分析，並顯示與graphviz樹的問題。我完成了Studer等2011所描述的一切（Guillet et al：Advances in Knowledge Discovery and Management）。我用的是disstree命令來構建我的樹叫tree.lcp，然後嘗試用graphviz的，以顯示它：顯示R中的差異分析樹（使用graphviz）

seqtree2dot(tree.lcp, filename="hh.lcp", seqdata=seqhh) 

shell("dot -Tsvg -O hh.lcp.dot")

有與第一命令沒有問題，但第二個帶來了此錯誤消息：

找不到命令「點」。
錯誤消息：
1：命令 'C：\ Windows \ System32下\ cmd.exe的/ C點-Tsvg -O hh.lcp.dot' 給狀態1
2：在外殼（「DOT -Tsvg -O hh.lcp.dot「）： ‘點-Tsvg -O hh.lcp.dot’進程失敗 - 錯誤代碼1

我想它是與第零路徑命令（見GraphViz: Windows PATH not set with new installer, issue when calling from R），但我將GraphViz安裝到C：\ Program Files（x86）\ Graphviz2.36，我知道這是默認設置。

任何想法，問題在哪裏？如果問題仍然是路徑命令，我怎麼能在shell命令中包含路徑？

謝謝！ Katharina

來源

2014-04-23 user3534907

如下

shell(paste('"C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/dot"','-Tsvg -O hh.lcp.dot'))

但是您可以指定路徑，如果你想從序列之間相異繪製一棵樹，你可能更好地使用新的簡化seqtreedisplay功能直接從生成的情節seqtree對象，即seqtree函數的結果。通常，seqtreedisplay應該自己找到Graphviz。

有關更多詳細信息，請通過輸入help(seqtreedisplay)來查看幫助頁面。

來源

2014-04-23 16:29:37 Gilbert

最新的TraMineR版本有一個直接運行所有內容的新功能。該功能稱爲seqtreedisplay。

seqtreedisplay(tree.lcp, type="d")

嘗試運行：TraMineR.checkupdates()知道你是否有最新的穩定版本。

來源

2014-04-23 14:33:39

@ gilbert @Mattias Studer：seqtreedisplay，或者更準確地說，disstreedisplay命令正是我所需要的。 Graphviz是自動發現的，現在我有樹了。謝謝！ Katharina – user3534907

@Katharina請投票並接受其中一個答案（Gilbert的看起來更加精確）。如果你這樣做了，那麼遇到類似問題的未來讀者將會如何解決它。 –

顯示R中的差異分析樹（使用graphviz）

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