什麼是「 - ;」意味着在bash聲明的結尾？

bwa sampe ref.fa r1.sai r2.sai r1.fq r2.fq | samtools view -bSho out.bam -;

是什麼目的「 - 」;角色在最後？他們在做什麼？他們爲什麼需要？

2012-04-26 E.Cross

如果它是一個表情，然後他們忘了，包括笑臉。（ - ; – phatfingers 2012-04-26 20:26:02

分號結束命令（以結束管道，我相信在技術上是正確的說法）。如果你願意，你可以使用另一個命令，如

bwa sampe ref.fa r1.sai r2.sai r1.fq r2.fq | samtools view -bSho out.bam -; echo Here is another command.

否則，分號是無害的，但可能不必要。

關於分號前面的-連字符，對於samtools和其他許多命令，它意味着使用標準輸入代替輸入文件（或者在某些情況下，使用標準輸出代替輸出文件）。這是典型的Linux/Unix用法。

（感謝@phatfingers用於驗證samtools命令的用法。）

2012-04-26 17:09:20 thb

啊，我現在對它的理解是「這是管道的東西」，如果有道理的話！很酷，謝謝！ – 2012-04-26 17:55:47

http://linux.die.net/man/1/samtools的手冊頁證實您的聲明在標題爲「描述」的部分 – phatfingers 2012-04-26 20:28:47

分號並不意味着結束「管道」，它意味着命令或語句的結束，或者是分隔符，即「for ls'中的x;執行echo $ x; done「可以被認爲是一個管道，但有兩個分號，雙分號用於大小寫分隔符 – 2012-04-27 01:53:15

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