如何在Pandas中調試Cython代碼？

我已經下載熊貓源，現在試圖調試它。我修改Makefile文件：如何在Pandas中調試Cython代碼？

sparse: pandas/src/sparse.pyx 
python-dbg setup.py build_ext --inplace --pyrex-gdb 

build: clean_pyc 
python-dbg setup.py build_ext --inplace --pyrex-gdb 

develop: build 
-python-dbg setup.py develop --pyrex-gdb

另外我有一個非常簡單的腳本：

from numpy import asarray 
from pandas import algos 

v = [4171.0, 0.0] 
expAverage = algos.ewma(asarray(v), 50, 1) 

print expAverage

當我嘗試使用python-DBG test1.py運行它，這就是我得到：

/tmp/1/pandas/pandas/hashtable.so: undefined symbol: Py_InitModule4_64 
Traceback (most recent call last): 
    File "test1.py", line 2, in <module> 
    from pandas import algos 
    File "/tmp/1/pandas/pandas/__init__.py", line 6, in <module> 
    from . import hashtable, tslib, lib 
ImportError: /tmp/1/pandas/pandas/hashtable.so: undefined symbol: Py_InitModule4_64 
[94423 refs]

有什麼不對？

來源

2013-12-13 relgames

其實我覺得它只是爲方便調試cythong時，只是把打印語句（老同學），但相當快。 – Jeff

嗨@Jeff，我發現你的評論非常有趣。我既不是熊貓也不是Cython/Python用戶，但我已經在SAS中編程。我的教授從來沒有教過我們使用調試器，我們總是被告知在編譯時只是使用print語句來檢查我們的程序。所以，一般來說，即使我們在其他編程語言中使用它們，您也認爲將打印語句與調試器一樣有效？看起來Pandas擁有比R. Cheers更爲一致的語法。一般調試器中的 –

都不錯（例如pdb）。我只是指出，對於一個相對簡單的函數和一個快速的編譯運行循環來說，打印語句通常就足夠了 – Jeff

很顯然，至少有一個正在加載的（C）擴展沒有以python-dbg可以使用的方式用調試信息進行編譯。

這一解釋的細節：

http://hustoknow.blogspot.co.uk/2013/06/why-your-python-program-cant-start-when.html

對我來說，好像--with-pydebug標誌並不等同/觸發相同的操作--pyrex-gdb。順便說一句，看來--pyrex-gdb已被重命名爲--cython-gdb。

您可以用cygdb或cython --gdb代替嗎？好像你正在使用已報告不工作的標誌：https://groups.google.com/forum/#!topic/cython-users/K6sjhzUX5JA

來源

2015-04-03 09:26:49 LetMeSOThat4U

感謝您的回答。但是我很久以前就無法檢查它（實際上Python代碼只是一個原型，而我用Java重寫了所有內容）。 – relgames

如何在Pandas中調試Cython代碼？

回答

相關問題