如何將變量傳遞給R markdown .Rmd文件？

我正在嘗試創建一個通用的rmarkdown模板，它將對數據幀進行分析。我希望能夠將數據幀傳遞給一個rmarkdown文件，而不是每次都對其進行硬編碼。如何將變量傳遞給R markdown .Rmd文件？

下面是我一直在試驗的一個片段。你可以看到，在頂部我必須加載數據幀（mtcars）。我還手動識別自變量（ivs）和因變量（dvs）。我想將它們作爲參數傳遞。我試圖做一個快速和骯髒的SPSS Explore功能版本。「Explore.Rmd」：

```{r} 
library(ggplot2) 
data(mtcars) 
mtcars$am <- factor(mtcars$am, levels=c(0,1), labels=c("Manual", "Automatic")) 
df <- mtcars 
ivs <- c("cyl", "disp", "hp", "drat", "wt", "am", "qsec") 
dvs <- c("mpg", "qsec") 
``` 

Histograms 
------------------------------------- 

```{r} 
for (v in union(ivs, dvs)) 
{ 
    hist <- ggplot(df, aes_string(x=v)) + geom_histogram() 
    print(hist) 
} 
```

我想有一些代碼看起來是這樣產生使用knitr或類似的東西的HTML。

myDF <- read.delim("mydata.tab") 
ivs <- c("iv1", "iv2", "iv3") 
dvs <- c("dv1", "dv2", "dv3") 
magic("Explore.Rmd", myDF, ivs, dvs) # <- how do I do this part?

那麼，是否有可能有一個靜態的rmarkdown文件並將參數傳遞給它？或者是否有另一種方法來完成我想要做的事情？

來源

2013-09-21 Jim

看看'knit_expand（）' – baptiste

哪裏我們能找到'knit_expand'函數嗎？你在說這個：http://cran.r-project.org/web/packages/knitr/vignettes/knit_expand.html？ –

我覺得你可以用knit2html從knitr包來做「魔術」。

定義你的降價文件，這樣並保存爲mydoc.Rmd

```{r} 
source('test.R') 
``` 
```{r} 
library(ggplot2) 
for (v in union(ivs, dvs)) 
{ 
    hist <- ggplot(myDF, aes_string(x=v)) + geom_histogram() 
print(hist) 
}

在test.R您準備數據：

myDF <- read.delim("mydata.tab") 
ivs <- c("iv1", "iv2", "iv3") 
dvs <- c("dv1", "dv2", "dv3")

您編譯使用knitr
```
Knit2html('mydoc.Rmd') 
```

來源

2013-09-21 08:38:07 agstudy

嗯..所以數據在哪裏傳遞？當用戶運行'Knit2html（'mydoc.Rmd'）'時，不應該在該調用中傳遞「mydata.tab」？ – rmf

我認爲替代在https://github.com/yihui/knitr/issues/567

給出你將不得不提前創建這些參數，例如

args='2013' 
knit('../my.Rmd','test.html')

內my.Rmd;然後knit()將識別ARGS看到envir說法，如果你想了解細節

來源

2014-10-03 09:01:06 SamGG

另一種選擇是要列出rmarkdown::render功能使用params的變量，請參閱：http://rmarkdown.rstudio.com/developer_parameterized_reports.html。

rmarkdown::render("MyDocument.Rmd", params = list(df = myDF))

然後調用參數在YAML：

--- 
title: My Document 
output: html_document 
params: 
    df: myDF 
---

然後可以在報表主體由分配：

來源

2016-06-21 09:17:56 Pete900

如何將變量傳遞給R markdown .Rmd文件？

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