fipy-level set 1D

Question

我試圖運行下面的代碼來設置1D級別的問題（例如在fipy網頁中）。我收到此錯誤： var.calcDistanceFunction 20行（

回溯（最近通話最後一個）： 文件 「/用戶/ sgowda /文檔/ PDE求解器代碼/級別設置1D.py C」 ） 文件「C：\ Users \ sgowda \ AppData \ Local \ Continuum \ Anaconda \ lib \ site-packages \ fipy \ variables \ distanceVariable.py」，第335行，在calcDistanceFunction 引發異常，「既不lsmlib也不skfmm可以在$ PATH」 異常發現：無論是lsmlib也不skfmm可以在$ PATH

可否請你讓我知道如何解決這一發現。我試圖調查distancefucntion（），但我不知道這個錯誤是什麼意思？

from fipy import Grid1D, CellVariable, TransientTerm, DiffusionTerm, Viewer, DistanceVariable 
import matplotlib.pyplot as plt 

velocity = 1. 
dx = 1. 
nx = 10 
timeStepDuration = 1. 
steps = 2 
L = nx * dx 
interfacePosition = L/5. 

from fipy.tools import serialComm 
mesh = Grid1D(dx=dx, nx=nx, communicator=serialComm) 

var = DistanceVariable(name='level set variable', 
         mesh=mesh, 
         value=-1., 
         hasOld=1) 
var.setValue(1., where=mesh.cellCenters[0] > interfacePosition) 
var.calcDistanceFunction() 

advEqn = TransientTerm() + FirstOrderAdvectionTerm(velocity) 

viewer = Viewer(vars=var, datamin=-10., datamax=10.) 
viewer.plot() 
for step in range(steps): 
    var.updateOld() 
    advEqn.solve(var, dt=timeStepDuration) 
    viewer.plot() 

plt.show() 

Answer 1

FiPy沒有達到母語水平集實現，因此使用任何LSMLIB或Scikit-FMM提供級別設置/快速行進方法的功能。

要查看是否有他們正確安裝，使用

$ python -c 「import pylsmlib; pylsmlib.test()」 

或

$ python -c 「import skfmm; skfmm.test()」 

測試。

要求是FiPy文檔中列出，請參閱http://www.ctcms.nist.gov/fipy/INSTALLATION.html#level-set-packages

這可能是更容易安裝最初Scikit-FMM，見https://pythonhosted.org/scikit-fmm/，但

$ pip install scikit-fmm 

應該工作。