如何在Python中取消引用HDF5引用？

Question

有時我得到以下陣列從我的HDF5文件：

val1 = {ndarray} [<HDF5 object reference> <HDF5 object reference> <HDF5 object reference>] 

如果我試圖取消對它的引用與HDF5文件對象

f[val[0]] 

我得到一個錯誤

Argument 'ref' has incorrect type (expected h5py.h5r.Reference, got numpy.object_) 

Answer 1

我我在試圖回答這個問題的時候遇到了這個問題，結果基本上是另一種形式的the same question。包含對其他對象的引用的數據集在HDF5中有點尷尬，但實際上你可以用一種非常直接的方式閱讀它們。這個想法是獲取被引用對象的名稱，然後直接從該文件中讀取該對象。

給定一個HDF5參考，ref和文件，file，您可以通過返回引用的數據集的名稱：

>>> name = h5py.h5r.get_name(ref, file.id) 

然後，只需讀取的實際數據集本身，像往常一樣：

>>> data = file[name].value # ndarray with the data in it. 

因此，要讀取所有參考數據集，只需要在整個參考數據集中包含map這個過程。