熱圖選擇列，我再次需要你的幫助:)爲R中
我寫的R腳本，產生熱圖出一個給定的選項卡分隔的TXT或XLS文件。目前，我在xls文件中手動刪除熱圖中不想包含的所有列。 現在我想使自動化，但我不知道該怎麼:(
有趣的列都開始在所有的xls文件相同的，其次是個人的名字：
XLS文件1：L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx
XLS文件2：L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx L4_tpm_xxxx L5_tpm_xxxx
任何想法如何選擇這些列
感謝你在期待，在菲利普
你可以使用（如果你已經在data.frame df讀取數據）：
df <- df[,grep("^L[[:digit:]]+_tpm.*",colnames(df))]
，或者你可以明確寫入所需的列：
df <- df[,c("L1_tpm_xxxx","L2_tpm_xxxx","L3_tpm_xxxx")]
等。 。
以下link是非常有用的;-)
您的代碼對於名爲「L10_tpm_abcd」的列不會成功。我會建議「^ L [0-9] + _ tpm」 – 2010-06-02 16:02:22
首先感謝您的幫助！ 我使用read.table作爲txt文件，但是從excel文件的「gdata」包中讀取xls。還沒有時間來測試它，但這是否也適用於read.xls？ – Philipp 2010-06-02 19:36:10
gd047：感謝您的評論，代碼相應改變。 Philipp：我想'read.xls'正在讀取data.frame中的數據，所以它應該也能正常工作。 – teucer 2010-06-03 06:55:25
如果您認爲列位置將在Excel表格中修復，這裏最簡單的解決方案就是使用列索引。例如，如果使用read.table將製表符分隔的文本文件導入爲data.frame，然後決定只保留前兩列，則可以這樣做：
data <- read.table("path_to_file.txt", header=T, sep="\t")
data <- data[,1:2]
該死的，這本來是很容易的;-) 不幸的是，他們並不總是有相同的指數^^ 但無論如何感謝！ – Philipp 2010-06-02 19:32:37
你可以看看http://stackoverflow.com/questions/1402634/choose-variables-based-on-name-simple-regular-expression或http://stackoverflow.com/questions/2125231/subsetting-in-r -using-or-condition-with-strings – Marek 2010-06-02 15:35:17
謝謝你的鏈接！ – Philipp 2010-06-02 19:34:16