如何使用rpy2從python獲得n-dim數組

Question

我想使用python進行一些計算，並將數組數據放到r中以獲得一些圖。

對於1維數組，我可以使用FloatVector得到正確的答案，但n維數組錯誤

（運行下面的代碼）

（2維數組）
import numpy as np from rpy2.robjects.vectors import FloatVector x = np.array([[1, 2], [3, 4]]) X = FloatVector(x)

錯誤信息：

`Traceback (most recent call last): 
File "<stdin>", line 1, in <module> 
File "D:\Program\Anaconda3\lib\site-packages\rpy2\robjects\vectors.py", line 456, in __init__ 
obj = FloatSexpVector(obj) 
ValueError: Error while trying to convert element 0 to a double.` 

使用numpy2ri可以使錯誤在一些情節的訂單（如GGPLOT2）

我想在spyder中完成所有這些工作。

Answer 1

轉換機制可以是您的朋友：

from rpy2.robjects.conversion import localconverter 
from rpy2.robjects import numpy2ri 

with localconverter(numpy2ri.converter) as cv: 
    X = cv.py2ro(x) # convert from *py*thon to *ro*bjects 

否則，這種情況正在發生，因爲rpy2正試圖通過 遍歷序列x（默認行爲，而互動與要求numpy的 ），使每個元素通過迭代一個R/rpy2對象。 這裏它不起作用，因爲x[i]轉向FloatVector，並且你不能有FloatVectorFloatVector元素（你可以有一個FloatVector列表）。顯然，這是發生了什麼事（你會觸發相同的錯誤）：

FloatVector([FloatVector(y) for y in x])