darray和mpi中的子數組有什麼區別？

Question

我有一個並行編程類的並行I/O項目，我必須實現派生數據類型。我沒有清楚地理解darray和子陣列之間的區別。 darray可以從動態分配的數組中派生嗎？主要區別是什麼？

Answer 1

子數組允許您描述更大的多維數組的單個塊/切片。如果每個MPI任務都有一個大型全局數組的單個片/塊（或者如果您正在任務之間傳遞本地數組的塊），那麼MPI_Type_create_subarray是要走的路;語法非常簡單。爲了解決像常規網格上的PDE這樣的事情，這種分佈非常普遍 - 每個處理器都有自己的全局網格塊，儘可能多的網格單元是本地的。在MPI-IO的情況下，每個MPI任務都會創建一個與其全局數組相對應的子數組，並使用它作爲視圖將其部分域讀入/寫出到包含所有數據的文件中。

MPI_Type_create_darray允許比單個塊更復雜的分佈式陣列模式。對於分佈式線性代數計算，分佈某些矩陣可能是有意義的 - 比方說，如果有5 mpi的任務，任務0獲得第0,5,10行...和任務1獲得第1,6,6,8行， 11，等等。其他矩陣可能按列分佈;或者您可以將它們分佈在行，列或兩者的塊中。這些數據分佈與命運不佳的HPF中的數據分佈相同，因此您可以通過這種方式逐個數組地定義數組的數據並行佈局。

我自己曾經使用MPI_Type_create_darray的唯一方法，也是我見過它的唯一方法，就是創建一個大矩陣的MPI文件視圖，以便以block-cyclic的形式分配數據，這樣可以讀取該文件，然後使用scalapack在分佈式矩陣上執行並行線性代數運算。