我想在不同的機器集（具有Open Mpi 1.5的所有Linux機器）上運行帶有mpirun的程序。配置MPI hosts文件以使用多個用戶標識
現在我有機器在那裏我可以登錄username A，和另一組機器，我使用username B。所有機器都可以通過SSH訪問，但我無法弄清楚如何實現這一點。
我的hosts文件會是這樣的：
localhost #username local
machine_set_A_1 #username A
machine_set_A_2 #username A
...
machine_set_B_1 #username B
machine_set_B_2 #username B
...
它是實現這一目標成爲可能。謝謝。
通常，您只需在每臺要運行mpi作業的機器上安裝mpi。然後在您的mipexec調用中，您將指定標識具有mpi的主機/機器的機器文件。 mpi smpd /守護進程將在每臺主機上爲您啓動作業。
實施例：
mpiexec -f machinefile -n 32 a.out
機文件看起來像：
host1.some.place:16
host2.some.place:16
這意味着兩個主機與每個16個核。
參考：
我能想到的要做到這一點的唯一方法是創建您的進程啓動做SSH USER1 @主機對一些包裝，而對於其他用戶2 @主機名。您可以通過
mpirun -mca orte_rsh_agent "/path/to/mysshwrapper" -machinefile machines.txt -np 4 ./subarray
設置進程啓動SSH代理，然後你必須適當的用戶名參數注入呼叫從自己包裝爲SSH。
您當然還必須設置ssh密鑰，以便您登錄其他用戶名帳戶時將無密碼。
可以創建一個SSH客戶端配置文件，並用'Host'關鍵字指定不同的主機配置。對於每個主機，可以用'User'關鍵字指定登錄用戶名。應該比創建包裝腳本更簡單。 –
@HristoIliev是的，這在簡單性和實用性方面都是一個更好的答案（即使在mpirun之外，這也是有用的）。你應該把它作爲一個正確的答案，而不是對這個問題發表評論，這樣才能獲得應有的知名度。 –
試圖找到我自己的問題的解決方案我剛剛找到類似的東西（在http://wiki.mpich.org/mpich/index.php/Using_the_Hydra_Process_Manager）。這可能對您有所幫助，但這是針對MPICH的。
使用水潤上機與不同的用戶名
水潤只支持一些發射器（如ssh和rsh），使用不同的用戶名。爲此，主機文件應該包含一個「user =」條目。
一個例子
shell$ cat hosts
donner user=foo
foo user=bar
shakey user=bar
編輯
有關的openmpi請參考：http://www.open-mpi.org/faq/?category=rsh#rhosts-file
OpenSSH客戶端支持每個主機配置，與此類似：
Host machine_set_A_1 machine_set_A_2 ...
User username_A
Host machine_set_B_1 machine_set_B_2 ...
User username_B
Host指令將以下所有聲明（直到下一個Host指令）都限制爲僅適用於與主機名相匹配的連接，該連接與指令後給出的任何模式相匹配。
SSH客戶端配置文件通常在/etc/ssh/ssh_config（系統範圍配置）和~/.ssh/config（用戶特定配置;指令覆蓋來自系統配置的那些指令）中找到。
ssh_config(5)的手冊頁包含關於可用關鍵字的更多信息，以及有關支持哪些模式的更多信息（使用類似Host *.groupA.uni.edu（如果適用）可以節省某些鍵入的內容）。
+1;我認爲這顯然是做到這一點的方法。 –
@JonathanDursi，你的回答適用於更一般的情況，因爲包裝器也可以做其他不同的事情，而不是簡單地指定正確的用戶名（例如提供與SGE之類的集成）。你不應該刪除它。 –
回想起來，它似乎是黑客，但如果你認爲它可能在其他一些情況下有用，我會取消刪除。 –
linux，unix或Windows？ – Martlark
什麼版本的mpi？ – Martlark
所有具有Open Mpi 1.5的Linux機器，問題更新 – 0xFF