graph-tool

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看過令人印象深刻的performance comparison後，我決定試試圖形工具。所以爲了比較，我編寫了代碼來使用這兩個包生成隨機樹。圖表工具代碼： import numpy as np import graph_tool.all as gt # construct an initial graph with two nodes and one link n = 5000 G =

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關於graph_tools的推論的AttributeError

我正在使用Python圖形工具庫對圖形進行一些推理，並且引用了下面的鏈接，它顯示了API和一些示例。 https://graph-tool.skewed.de/static/doc/inference.html#graph_tool.inference.BlockState 我的代碼寫在下面，如下所示，其中g是在上一步中定義的有向邊緣加權圖。 g.save(graph_file_name) g

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當使用圖形工具繪圖時，停止頂點互相重疊

我在Python 3.5.1上使用圖形工具。我有一個單詞的圖形，單詞之間的邊緣韻。當我使用圖形工具的繪圖函數時，如果我使頂點過大，它會導致所有頂點重疊，但如果它們太小，我必須使字體變小，然後難以辨認。有沒有設置最小邊長或強制頂點不重疊的方法？代碼示例： import graph_tool.all as gt G = gt.load_graph("G.gt") gt.graph_draw(G

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圖形工具Git版本（1.13）中沒有可用的「配置」

我已經從Git下載了圖形工具v1.13（https://git.skewed.de/count0/graph-tool）。 INSTALL文件指示我在源代碼的目錄中運行./configure，但configure文件不存在。我需要做什麼來安裝它？編輯：如果我在我得到以下消息的目錄運行autoconf： sh: 1: git: not found sh: 1: git: not found c

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配置需要C++ 14支持，但gcc -v = 4.9.3

我目前正在從Git版本編譯graph-tool v1.13的過程。我已經設法從autogen.sh生成configure文件，但我現在遇到了麻煩。運行./configure我收到消息： checking whether g++ supports C++14 features by default... no checking whether g++ supports C++14 feature

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graph_tool graph_draw頂點文本框邊距頂點重疊

我試圖將使用python graph_tool庫創建的圖形輸出到PNG文件。最終的結果是繪製的圖頂點重疊。我意識到問題是當我把文本放在頂點或邊上時，就像文本框的邊距太大。 size = 4000 v_size = size/my_graph e_pwidth = v_size/10 graph_draw(my_graph, vertex_shape='square', vertex_text

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從源代碼編譯圖形工具 - 找不到可用的boost :: coroutine找到

我目前正在從源代碼編譯v1.13開發過程中。我使用autogen.sh生成了配置文件。我正在使用命令./configure --enable-openmp CXX='g++-5'運行配置腳本，但是這會返回錯誤configure: error: No usable boost::iostreams found。我不記得當我編譯v1.12時遇到這個錯誤，但也許我只是不記得了。我檢查了使用Anacond

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graph-tool -k-最短路徑 - 編譯時未找到boost :: coroutine

我試圖在有向圖中找到兩個節點之間的k個最短路徑。爲此我運行下面的代碼片段： g = load_graph('graph.xml') source = find_vertex(g,g.vp.xrn, '774123') source = source[0] target = find_vertex(g,g.vp.xrn,'636131') target = target[0] for pa

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在圖形工具中過濾一個子圖

這是一個關於圖形工具的荒謬的基本問題，它應該是微不足道的以找出如何使用文檔解決問題，但我正在旋轉。我不懷疑文檔是全面的，但它肯定不會讓這種簡單。目標：給定一個圖G，基於提取G. 的頂點列表，我知道我應該用GraphView某種方式做這個的導出子。我明白了。我也明白，我需要爲此創建一個頂點PropertyMap。但是我應該創建什麼？這裏的文檔很缺乏。例如，page on PropertyMaps

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圖形工具重疊塊對象

如何將重疊塊狀態中每個節點的塊成員轉換爲numpy數組？具體來說，推斷重疊塊對象時，它看起來像重疊成員陣列可以 blockobject = gt.minimize_blockmodel_dl(g, overlap = True) blockpropertyvector = blockobject.get_overlap_blocks()[0] 將其轉換成numpy的陣列恢復，看來我們需要有