r-ape

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來自系統發育樹的簇

我有一個系統發育樹，它顯示了基因以及它們如何聚集在一起。它使用歐幾里德距離矩陣和ape包進行繪製。 有關更多詳細信息，請參閱前面的鏈接。 Phylogenetic tree 這是我的數據（gg.txt），將其轉換爲一個基因矩陣。 ID gene1 gene2 1 ADRA1D ADK 2 ADRA1B ADK 3 ADRA1A ADK 4 ADRB1 ASIC1 5 ADRB1 ADK

r tree hierarchical-clustering phylogeny r-ape 2014-02-21

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Python ete3 - 有沒有方法可以拉伸系統發生樹的分支？

我正在嘗試閱讀系統發育樹，並將它的分支伸展得比原來的更大或更小，但我沒有找到如何。 伸展需要在樹上 - 而不是它的可視化。 例如，下面的代碼讀取一棵樹，並提出它： from ete3 import Tree t = Tree("(2azaa:0.1871453443,1dz0a:0.1944528747, (((1joi:0.1917345578,1nwpa:0.206793251):0.20

python phylogeny ete3 r-ape 2017-04-15

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