ete3

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有沒有什麼辦法可以讓二叉搜索樹有簡單的ascii可視化？

我開發了一個二叉搜索樹結構，我想添加一些可以可視化樹的功能。 下面的代碼屬於二叉搜索樹： class Node(object): def __init__(self, data): self.data = data self.leftChild = None self.rightChild = None def insert(self, d

algorithm python-3.x binary-search-tree ete3 2016-09-21

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ete3：如何從分類標識中獲得分類級別名稱？

我想用它來轉換一堆標識符，但我需要確切地知道哪個分類等級被分配給每個分類標準代碼。下面顯示的是一個有意義的轉換示例，但我不知道如何標記某些分類調用。基本的分類等級是:(域，王國，門，類，次序，家庭，屬和物種）https://en.wikipedia.org/wiki/Taxonomic_rank。 對於大多數情況下，它很容易，但在細菌的亞種和菌株的情況下，這可能會引起混淆。 如何獲得ete3來指定

python bioinformatics taxonomy ncbi ete3 2017-09-10

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Python ete3 - 有沒有方法可以拉伸系統發生樹的分支？

我正在嘗試閱讀系統發育樹，並將它的分支伸展得比原來的更大或更小，但我沒有找到如何。 伸展需要在樹上 - 而不是它的可視化。 例如，下面的代碼讀取一棵樹，並提出它： from ete3 import Tree t = Tree("(2azaa:0.1871453443,1dz0a:0.1944528747, (((1joi:0.1917345578,1nwpa:0.206793251):0.20

python phylogeny ete3 r-ape 2017-04-15

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