sbatch

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我可以向SLURM提交「單行證」嗎？使用由LSF和標準的Linux工具xargsbsub，我可以很容易地提交單獨的作業進行解壓縮所有文件的目錄中： ls *.gz | sed 's/.gz$//g' | xargs -I {} bsub 'gunzip -c {}.gz > {}' 使用SLURM，我認爲srun或sbatch會工作，但無濟於事： ls *.gz | sed 's/.gz$/

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SLURM：如何在同一個計算節點或不同節點上並行運行不同的可執行文件？

目標：學習如何運行或共同計劃或執行操作/使用或者SRUN或的mpirun 研究與sbatch作業提交應用：代碼段： #!/bin/bash #SBATCH --job-name LEBT #SBATCH --partition=angel #SBATCH --nodelist=node38 #SBATCH --sockets-per-node=1 #SBATCH --cores-p

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以指定數量的節點啓動slurm陣列作業

我正在嘗試使用slurm 14.03.0版在我們的HPC上對齊168個序列文件。我只允許一次最多使用9個計算節點，以便爲其他人保留一些節點。我改變了文件名，所以我可以在sbatch中使用數組函數。序列文件看起來像這樣： Sequence1.fastq.gz，Sequence2.fastq.gz，... Sequence168.fastq.gz 我似乎無法弄清楚如何告訴它運行所有168個文件，9一

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在Slurm羣集上運行批處理作業

因此，我花了幾個小時試圖弄清楚這一點，並希望得到任何幫助。我所試圖做的是用SLURM --array0-654 我想每個作業步驟運行8個線程運行批處理作業。我有權訪問集羣上的每個32個線程的11個節點，我似乎無法得到正確的SBATCH配置。它似乎要麼爲每個節點運行一個作業，要麼在所有節點上運行超過200個作業。我試過了許多不同的配置，並想知道是否有人有一些建議。