FORTRAN自啓動MPI程序

有沒有辦法在FORTRAN程序中調用mprirun？我正在通過ssh在公共Linux集羣上工作，主要想法是在程序執行結束後自動將其排入隊列。FORTRAN自啓動MPI程序

我試圖在節目的最後寫的是這樣的：

CALL system('mpirun -np 16 -maxtime 100 TestNP')

但收到此錯誤：

sh: mpirun: command not found

任何想法？

因此，嘗試在您的系統調用'mpirun'作爲前綴'mpirun'與您的系統上的'mpirun'的絕對路徑 - 如果你不知道是什麼看着在命令行使用哪個mpirun的結果。我對你爲什麼試圖這樣做有點困惑，你真的想在完成時重新提交程序嗎？（當然，重新提交它*無限*） –

是的，我正在處理長期的流體動力學模擬，所以程序應該執行很多次（因爲集羣上的計劃你不能啓動涉及多時間的計算過程）。因此，一次迭代結束後，數據將被保存以供下次啓動。現在我正在手動啓動，但這絕對不方便。 –

我想我明白你在做什麼，但我仍然不會使用'system'來調用它。我會做什麼取決於你沒有給我們的信息，比如你的集羣提供了什麼作業管理系統。 –

問題是缺少路徑前綴，因此指定mpirun的絕對路徑應該有所幫助。但是有幾個問題，你的方法：

通常，像這樣的任務是通過shell腳本完成的。例如。在bash，那麼你會寫是這樣的：

while true; do 
    mpirun your_program 
done

這不是之前由您或排隊系統殺死不斷重新調用的mpirun。（所以要小心與它！）

2013-01-09 12:12:52

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