聚類分析的距離計算

我想爲我的WorldClim數據運行聚類分析。我的數據集有236.000行。當我嘗試運行dist代碼時，R會發瘋，我必須關閉它。我搜索了它，發現這是因爲CPU。我找到了一個解決方案here但我得到這個錯誤聚類分析的距離計算

Warning in install.packages : 
    package 'rpud' is not available (for R version 3.2.0)

有沒有其他解決方案？

來源

2016-03-21 ismailb

該包已被archieved。您可以嘗試下載package並從源代碼安裝。這個軟件包的大問題是它需要使用cuda GPU。使用Google的強大功能nvcc安裝說明。

如果您使用Windows，您需要Rtools

來源

2016-03-21 15:51:05 csgillespie

它沒有工作。在啓動過程中 - 警告消息： 1：設置LC_CTYPE失敗，使用「C」 2：設置LC_TIME失敗，使用「C」 3：設置LC_MESSAGES失敗，使用「C」 4：設置LC_MONETARY失敗，使用「C檢查「環境變量CUDA_HOME」...「CUDA_HOME未設置;使用默認的/ usr/local/cuda」檢查/ usr/local/cuda/bin/nvcc ... no configure：error：「找不到nvcc;檢查CUDA安裝」錯誤：配置包'rpud'失敗 *刪除'/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rpud ' – ismailb

install.packages中的警告：安裝包'/ Users/isma il_b/Downloads/rpud_0.0.2.tar.gz'有非零退出狀態 – ismailb

您需要'nvcc'。嘗試使用谷歌搜索'nvcc Mac'它看起來不直截了當 – csgillespie

聚類分析的距離計算

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