R - 網絡數據進出R-鄰接矩陣到邊緣列表格式

我是一個使用R進行社交網絡分析的基本程序員，並且有一些我不知道如何解決的信息。R - 網絡數據進出R-鄰接矩陣到邊緣列表格式

我有：

存儲爲與下面的信息的CSV文件鄰接矩陣：一）行1戶與戶在通過資源共享彼此塔1相互作用。 b）互動是由親屬關係數字代表的關係。親屬關係越接近（或更強），數字越小。例如，1是親子親屬關係，100是親屬關係。沒有自我親屬關係。 C）文件片段：

 [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] 
[1,] NA 100 2 1 100 
[2,] 4 NA 100 100 3 
[3,] 100 3 NA 2 4 
[4,] 100 1 5 NA 100 
[5,] 1 100 4 100 NA

我所需要的：

我需要此鄰接矩陣轉換成邊表具有三個列（「HH1」，「HH2」，「HHKinRank」），以完成額外的親屬關係計算。

該邊緣列表必須保存爲新的csv文件以供進一步分析。

我對列表最大的問題是它只需要列出數值。如果沒有聯繫（NA），那麼邊界列表是否會顯示？

我做了什麼：

我試圖csv文件分配給新的變量 HHKinRank.el < - read.csv（「HouseholdKinRank.csv」）。

當我這樣做時，最令人沮喪的組件是確定我可能不得不使用的庫。有許多功能命令，如融化，所以故障排除是一個問題，因爲我也可能會錯誤地分配值。

我可以從邊緣列表轉到矩陣，但相反很難運行命令。

謝謝你對此的任何幫助。

來源

2016-02-21 Des

您可以使用R的network包進行此操作，也可以使用igraph。

library(network) 

# create the example data 
adjMat <- matrix(c(NA, 100, 2, 1, 100, 
        4, NA, 100, 100, 3, 
        100, 3, NA, 2, 4, 
        100, 1, 5, NA, 100, 
        1, 100, 4, 100, NA), 
       ncol = 5,byrow=TRUE) 

# create a network object 
net<-as.network(adjMat,matrix.type='adjacency', 
       ignore.eval = FALSE, # read edge values from matrix as attribute 
       names.eval='kinship', # name the attribute 
       loops=FALSE) # ignore self-edges 

# convert to an edgelist matrix 
el <-as.edgelist(net,attrname = 'kinship') 

# relabel the columns 
colnames(el)<-c("HH1", "HH2", "HHKinRank") 

# check results 
el 
     HH1 HH2 HHKinRank 
[1,] 1 2  100 
[2,] 1 3   2 
[3,] 1 4   1 
[4,] 1 5  100 
[5,] 2 1   4 
[6,] 2 3  100 
[7,] 2 4  100 
[8,] 2 5   3 
[9,] 3 1  100 
[10,] 3 2   3 
[11,] 3 4   2 
[12,] 3 5   4 
[13,] 4 1  100 
[14,] 4 2   1 
[15,] 4 3   5 
[16,] 4 5  100 
[17,] 5 1   1 
[18,] 5 2  100 
[19,] 5 3   4 
[20,] 5 4  100 

# write edgelist matrix to csv file 
write.csv(el,file = 'myEdgelist.csv')

來源

2016-07-22 20:59:43 skyebend

R - 網絡數據進出R-鄰接矩陣到邊緣列表格式

回答

相關問題