在R中使用LIMMA時使用的數據格式

Question

有人可以給我一個當我將它導入到R中時導入到LIMMA中的微陣列數據應該是什麼樣子的小例子嗎？

我想破譯來自微陣列樣本的差異調節基因。謝謝。

Answer 1

一個製表符（或其他）與標準化的表達式級別分開的文件，另外還有一個帶有probeset id（或其他基因標識符）的列和一個定義樣本的標題 - 一般來說。

爲了獲得所需代碼的示例，我建議您檢查geo2r生成的腳本（可從任何GEO數據集訪問）並閱讀limma小插圖。